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背景:肺癌是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,在肺癌的所有病理类型中,约85%为非小细胞肺癌。在非小细胞肺癌中,以肺腺癌的发病最为普遍。但目前,肺腺癌发生的分子机制仍不十分清楚,预后较差,其5年总生存率仅不到20%。阐明肺腺癌发生的分子机制对于肺腺癌的早期准确诊断和有效治疗具有重要的理论意义和临床应用价值。通过系统生物信息学方法分析,识别与肺腺癌发生密切相关的重要通路、关键功能基因模块和基因。方法:本研究使用差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析和基因集富集分析等生物信息学方法分析四套独立的肺腺癌相关表达数据。其中,基因集富集分析方法被用来识别和发现与肺腺癌发生密切相关的重要通路。GO分析、KEGG通路分析及DO分析被用来揭示与肺腺癌发生相关的生物学过程及相关疾病。通过整合加权基因共表达网络分析和差异基因表达分析等方法联合寻找与肺腺癌发生相关的重要功能差异基因模块,然后使用生存分析来评估与总体肺腺癌存活显著相关的基因。最后,通过在线数据库Oncomine的多数据集验证识别与肺腺癌发生相关的关键基因,并构建相应的预后模型。结果:通过基因集富集分析发现与肺腺癌发生显著相关的通路有10个(显著上调的通路包括:Cell cycle,Pyrimidine metabolism,DNA replication,Base excision repair,Mismatch repair,显著下调的通路有:Complement and coagulation cascades,Vascular smooth muscle contraction,Chemokine signaling pathway,Hypertrophic cardiomyopathy,Cell adhesion molecules)。联合WGCNA、DEGA和单因素COX等分析方法,最终识别了10个重要的基因。通过在线数据库Oncomine进行多数据集的初步验证并构建预后模型,发现在这10个基因中有3个基因(包括DOCK4、GOLM1、VIPR1)与肺腺癌病人的存活率密切相关。结论:本研究识别了与肺腺癌发生相关的基因、通路及重要功能基因模块,这为系统揭示肺腺癌的分子机制提供了一些新的线索。这些识别的与预后相关基因可能可以作为潜在的诊断肺腺癌的生物标志物或治疗靶点。