肉牛PPARG基因单核苷酸多态性的研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lzslzs2002
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究采用PCR-SSCP技术与DNA测序相结合的方法对延边黄牛和红安格斯×西门塔尔(安格斯)、德国黄牛×西门塔尔(德国黄)、利木赞×西门塔尔(利木赞)、夏洛莱×西门塔尔(夏洛莱)4个二元杂交牛群体PPARG基因全部外显子及部分内含子进行SNP检测,分析PPARG基因的遗传特性,以期找到与延边黄牛肉质性状相关的SNPs位点,并对其关联性进行分析,结果如下:1. PPARG基因第1内含子发现1个突变位点:g.26106A→G;第2外显子发现1个突变位点:g.26760T→C;第3外显子发现1个突变位点:g.28735T→C;第5外显子发现2个突变位点:分别为g.42945A→G、g.43043T→A;第6外显子发现2个突变位点:分别为g.54266A→G、g.54359T→A;第1、4和7外显子不存在突变位点。2.对存在多态的intron1、exon3、 exon5和exon6进行遗传变异分析,分析了各多态位点在延边黄牛和红安格斯×西门塔尔(安格斯)、德国黄牛×西门塔尔(德国黄)、利木赞×西门塔尔(利木赞)、夏洛莱×西门塔尔(夏洛莱)4个二元杂交牛群体中的多态信息含量(PIC)、纯合度(Ho)、杂合度(He)、均质度(H.I)和有效等位基因数(Ne)。结果发现4个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。intron1多态位点中延边黄牛和安格斯、德国黄、利木赞3个二元杂交牛群体的多态信息含量(PIC)均处于中度多态,夏洛莱牛群体的多态信息含量(PIC)处于低度多态;在exon3、 exon5和exon6三个多态位点中延边黄牛和4个二元杂交牛群体的多态信息含量(PIC)均处于中度多态。3.采用一般线性模型进行了PPARG基因多态性与延边黄牛肉用性状的关联分析,结果显示:intron1多态位点中的TT基因型在降低牛肉蒸煮损失和提高花生四烯酸含量上有一定的正效应(P<0.05);CT基因型在提高组氨酸含量上有一定的正效应(P<0.01)。exon3多态位点中CC基因型对提高苏氨酸、谷氨酸和天冬氨酸含量有一定的正效应(P<0.01)。exon5多态位点中GG基因型对提高油酸、亚油酸、硬脂酸、α-亚麻酸、棕榈酸、棕榈油酸、肉豆蔻酸和精氨酸含量有一定的正效应(P<0.01)。exon6多态位点中TT基因型对剪切力和花生四烯酸含量有一定的负效应(P<0.05),对提高蛋白质含量有一定的正效应(P<0.01)。
其他文献
随着我国经济持续、高速的发展,草坪面积不断增长,从庭院、园林绿化向运动场、水土保持、风沙治理、盐碱地改良等领域拓展。城市化进程的加快给我国草坪业带来了快速发展的契
利用自制微孢子虫(Nosema apis)悬液(5.5×10~7个孢子/毫升)与50%的白糖水1:1混合,以每次20毫升剂量对幼年健康意蜂(Apis mellifera)进行感染,每日一次,连续21次,制作动态病理模型。
微孢子虫是一类广泛存在的,无线粒体的单细胞原生动物寄生虫。微孢子虫-能感染寄生脊椎动物和无脊椎动物,是经济昆虫、鱼类、兔类、皮毛动物、啮齿类及灵长类动物的致命病原。
随着“中国智造”时代的到来,应用型理工科大学的特色发展越来越受到国家的重视,培养的人才将会成为中国工业的重要力量.人才的素质和能力,是判断人才水平的基本准则,也是判
以对桑黄化型萎缩病具有不同抗性的桑树品种为材料,测定各品种在自然条件下、光氧化条件下和感染桑黄化型萎缩病条件下叶绿素荧光参数和活性氧代谢的关键指标,以揭示桑黄化型
昆虫杆状病毒是潜在的无污染杀虫剂,但是其缓慢的发病致死作用,极大地限制了它作为杀虫剂的应用.杆状病毒的蜕皮甾体尿苷二磷酸葡萄糖基转移酶(egt)基因为病毒复制的非必需基