【摘 要】
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肉鸡的体重增长速度是其养殖生产中最重要的一项经济性状,研究表明肉鸡的肠道微生物可通过调节宿主的能量代谢及消化吸收从而影响宿主的体重增长。为了更好地了解肉鸡生长发育过程中其肠道微生物群落的动态变化及其与宿主体重的相关性,本研究对天府肉鸡60个个体的粪便微生物和6个个体的盲肠组织分别进行了16s r RNA和转录组测序,探究了4至16周龄肉鸡生长发育过程中肠道微生物的多样性和功能的变化,并筛选出与宿主
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肉鸡的体重增长速度是其养殖生产中最重要的一项经济性状,研究表明肉鸡的肠道微生物可通过调节宿主的能量代谢及消化吸收从而影响宿主的体重增长。为了更好地了解肉鸡生长发育过程中其肠道微生物群落的动态变化及其与宿主体重的相关性,本研究对天府肉鸡60个个体的粪便微生物和6个个体的盲肠组织分别进行了16s r RNA和转录组测序,探究了4至16周龄肉鸡生长发育过程中肠道微生物的多样性和功能的变化,并筛选出与宿主体重增长具有显著相关性的候选微生物。同时结合肠道微生物的功能预测及盲肠的转录组数据分析探究肉鸡肠道微生物对宿主体重增长的影响机制。主要结果如下:1、在肉鸡4至16周龄的生长发育过程中,其肠道微生物的α多样性呈缓慢下降趋势,且不同时间点之间的β多样性和肠道微生物组成均存在显著差异。其中相对丰度显著下降的肠道微生物主要包括厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)(P<0.05)。2、微生物功能的变化主要集中在代谢、遗传信息处理和环境信息处理等相关功能通路,并总体上呈现出下降趋势。3、鉴定到6个与体重呈现显著相关的肠道微生物属(P<0.05),其中苏黎世杆菌属(Turicibacter)、卡氏杆菌属(Gallibacterium)和芽孢杆菌属(Lysinibacillus)与体重呈显著正相关,链球菌属(Streptococcus)、棒状杆菌属1(Corynebacterium1)和毛螺菌属(Lachnospiraceae)与体重呈显著负相关。4、高体重组和低体重组肉鸡的盲肠转录组测序中共鉴定到6个主要与能量代谢和免疫应答相关的差异表达基因(ART4、MT-CYB、MT-ND4、ENSGALG00000033419、ENSGALG00000048383、LOC107051274)。综上所述,在肉鸡4至16周龄的生长发育过程中,其肠道微生物的组成和功能处于动态变化中,并主要通过影响宿主的能量代谢和免疫应答进而促进宿主的体重增长。本研究为今后肉鸡肠道微生物的研究及通过益生菌提高肉鸡养殖效率的思路提供了理论依据。
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