我国铁路集装箱物流中心，是国家开展多式联运服务以及现代物流服务的重要基地。“十一五”规划中明确指出建设18个集装箱物流中心。其主要业务范围涉及集装箱运输、堆存、装卸搬运以及一些辅助性的物流服务。现下快件门到门业务正如火如荼的进行，集装箱物流中心将对于大宗货物以及集装箱装运货物实现类似快递业的门到门服务。作为内陆集装箱运输的枢纽，铁路集装箱物流中心与公路、水路、航空及各地区经济中心紧密衔接，不仅提高了铁路物流效率及服务水平，拉动各地区集装箱运量，而且不断完善并扩大我国集装箱运输网络。就目前已建成并运营的物流中心来看，铁路集装箱物流中心运营状况良好，成果喜人。同时，处于刚刚起步后的发展阶段，铁路集装箱运营中出现的问题以及集装箱运量的不断增大使得铁路集装箱物流中心内的设备设施需要进行不断调整，优化产业结构，提升物流中心整体运作效率，从而提高集装箱运输质量。基于此，利用计算机仿真软件对铁路集装箱物流中心进行设计优化，利用eM-plant软件层级设计的特点按照系统功能分成子系统，针对子系统找出存在的问题并提出合理化资源配置并优化，为今后铁路集装箱物流中心的后期建设以及运营改进提出可行方案。本文主要内容如下：(1)对铁路集装箱物流中心进行系统概述，详细阐述了物流中心的功能、布局；与港口集装箱物流中心不同，铁路集装箱物流中心在平面布局、设施设备的选择上可以借鉴港口物流，但是铁路集装箱物流中心根据自己的作业流程特点，选用的设施设备等不完全相同。文章同时指出铁路集装箱物流中心在规划建设和运营时期的调度原则问题。(2)从铁路集装箱物流中心的运营来看，其属于典型离散事件系统。Petri网能够很好的解决离散事件系统中时间众多、关系复杂、异步性、并行性等问题，本文建立Petri网系统逻辑模型较为清晰的表述出集装箱物流中心内列车到达子系统、大门作业子系统、集装箱装卸线作业系统以及内卡取放箱作业子系统。(3)根据Petri网建立的逻辑模型，运用仿真软件eM-plant对铁路集装箱物流中心作业进行系统建模，该模型包括集装箱列车进出物流中心的作业、装卸线主堆场作业、辅助堆场装卸作业以及外卡进出物流中心的作业。在将各个子系统的作业过程仿真的基础上，根据eM-plant的层式结构特点，将系统整合为一个总系统进行研究。(4)将某铁路集装箱物流中心2012年数据带入仿真模型中进行拟合，输入相关参数进入仿真模型，多次试验后，得出仿真数据并与实际集装箱物流中心所得数据进行比较，验证仿真模型的适用性与可行性。在此基础上，利用仿真模型对当前大门通道数以及堆场数的选择进行对比研究，得出结论。