水稻寡分蘖候选基因的定位、克隆及水稻白叶枯病抗性分子标记辅助育种

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 9次 | 上传用户:shshay
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水稻分蘖是产量构成的主要因素之一,也是单子叶植物分枝发育机理研究的模式植物系统。创造有关分蘖的突变体和分离相关基因,是研究分蘖调控机理的基础性工作。本研究对一份寡分蘖突变体进行了分离鉴定、遗传分析、基因的定位和候选基因克隆,并构建了开展功能验证的遗传转化载体。取得的主要结果如下: 1.从籼粳交(02428/圭630)花培后代中分离鉴定出一份寡分蘖突变体G069,并以02428作为轮回亲本进行连续回交和自交,建立了寡分蘖性状与02428的近等基因系G069-ftl。与02428相比,G069-ftl表现出最高分蘖少、分蘖速度慢、苗期和分蘖期叶尖黄化但后期逐渐恢复正常、成穗率高、穗顶部有颖花退化现象、再生能力强、植株矮化等特征。 2.在两种不同肥力和栽培密度条件下,对寡分蘖基因进行了遗传分析。结果表明,在两种处理条件下,寡分蘖性状在F2群体中均呈现明显的双峰分布,且两峰值分别与近等基因系G069-ftl和02428的分蘖数相近。统计结果表明,F2群体中正常分蘖植株与寡分蘖植株的分离比例符合单基因分离比例3:1(Xc2=0.5287<X0.05,12=3.84和Xc2=0.7265<X0.05,12=3.84),说明寡分蘖性状受一对隐性基因控制。 3.完成了寡分蘖基因的精细定位。利用分子标记成功地将该基因定位于水稻第二染色体上位于微卫星标记RM263和RFLP标记C424之间的RFLP标记S13984附近,并根据初步定位结果,从NCBI数据库中获得寡分蘖基因区域的局部物理图谱,利用日本晴数据库中BAC克隆的序列组装出该区域的完整基因组序列图谱,寻找新的分子标记进行寡分蘖基因的精细定位,获得两个与寡分蘖基因ftl共分离的STSs标记RDG219和RGD224,两标记间的物理距离为5.5kb。 4.进行了候选基因的预测和初步分析。以获得的共分离标记RGD219与RGD224之间的序列为中心,从NCBI和RGP获得其两侧各约40kb序列进行候选基因预测,共获得9个预测基因。通过保守序列分析和功能预测分析,初步确定了四个候选基因Ftl-f、Ftl-g、Ftl-h和Ftl-i。
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