rFN/CDH的亚细胞位点预测及基于LbL技术的rFN/CDH仿生界面的构建及初步评价

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第一部分基于改良周的伪氨基酸组成策略的rFN/CDH的亚细胞位点预测目的:随着后基因组时代的到来,蛋白质序列的数量正在迅速地增加。开发一个既准确又自动的方法来快速可靠地预测蛋白质的亚细胞位点成为了一种挑战。直到现在,虽然目前有许多预测蛋白质亚细胞位点的方法,但是大部分都只用到了单一的算法。方法:在本文中,我们提出了一个由KNN和SVM构成的集成分类器来预测蛋白质的亚细胞位点。这个集成分类器是通过一个投票系统将许多基本的独立的分类器融合而成的。结果:对于两组各三个蛋白质基准数据集,通过1对1策略获得的总的预测准确率分别是78.17%、89.94%、75.55%和95.22%、93.47%、80.72%。结论:文中提高的预测准确率提示基于改良周的伪氨基酸组成策略能够帮助更好地预测蛋白质(FN、CDH、rFN/CDH)的亚细胞位点。第二部分基于LbL技术的rFN/CDH仿生界面的构建及初步评价目的:本研究的目的是探讨基于层层自组装技术(LbL)构建重组蛋白质rFN/CDH仿生修饰BCP界面的可行性。方法:在前期工作中,我们利用标准基因克隆和蛋白质合成技术对rFN/CDH进行合成。利用静电吸附原理,我们基于LbL自组装技术构建了Chi-rFN/CDH的多层结构。并利用x线光电子分光镜检查(XPS)、傅里叶变换红外光谱(FTIR)、接触角和扫描电镜(SEM)对多层结构进行分析。结果:在前期工作中,我们成功制备了一段长1954bp的基因片段和80KD的rFN/CDH融合蛋白质。接触角实验提示:BCP界面在组装12层(即BCP-PEI-(rFN/CDH-Chi)5-rFN/CDH)后显示出最佳的亲水性。单纯BCP和组装12层的BCP表面接触角分别为45.0°和30.1°。XPS实验提示:在LbL自组装后,PEI、rFN/CDH、Chi的氮峰(400eV)和rFN/CDH的硫峰(164eV)证实了LbL自组装实验成功。SEM实验提示:在放大10000倍后,单纯BCP和经过LbL修饰后的BCP表面没有显著的差异。结论:利用LbL自组装技术,有效地将rFN/CDH组装到BCP陶瓷支架表面。
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ue*M#’#dkB4##8#”专利申请号:00109“7公开号:1278062申请日:00.06.23公开日:00.12.27申请人地址:(100084川C京市海淀区清华园申请人:清华大学发明人:隋森芳文摘:本发明属于生物技