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银杏（Ginkgo biloba L．）原产我国，是现存裸子植物中最古老的孑遗植物之一，被称为“活化石”。其寿命长，在我国许多地方分布着规模不等的银杏古树群落。湖北省是银杏古树的主要集中分布区之一。本研究从湖北省内采集259个银杏古树叶样，应用ISSR分子标记技术，对湖北省银杏古树的遗传多样性状况进行了研究，结果如下： （1） 用9条引物对3大群体共259个银杏叶样的基因组DNA进行PCR扩增，共得到120条清晰的扩增谱带。其中，多态性谱带114条，多态性带百分率（PPB）为95.00％。在物种水平，Nei’s基因多样性HE为0.2591，Shannon’s多态性信息指数HO为0.3971。这说明银杏在物种水平上具有较高的遗传多样性。 （2） 用多态位点百分率（PPB）、观测等位基因数（AO）、有效等位基因数（AE）、Nei’s基因多样性值（HE）以及Shannon’s多态性信息指数（HO）来度量3大群体内的遗传变异，表明大洪山群体遗传多样性水平最高，群体内遗传变异最大，其次为鄂西南山区群体，大别山群体的遗传多样性水平最低，群体内遗传变异也最小。 （3） Nei’s遗传多样性分析和AMOVA分析表明，三大区域群体间的GST为0.1687，φST=13.92％，即表明银杏古树群体的遗传变异主要分布在群体内。 （4） 对随州、安陆、巴东、麻城、罗田和红安等6个县市群体的遗传多样性分析表明，随州群体的多态性最高，其次为安陆群体，红安群体的多态性最低。这6个群体的HE值在0.1146～0.2403之间，平均为0.1868；HO值在0.1775～0.3694之间，平均为0.2857。罗田群体和红安群体的HE值和HO值均低于上述平均值。对6个县市群体的Nei’s遗传多样性分析和AMOVA分析表明，各县市群体间出现了较大的遗传分化(GST=0.2790，φST=20.10％)。 （5） 根据群体间的Nei’s遗传一致度（Ⅰ），应用UPGMA法构建群体间的聚类图。从中可以看出：鄂西南山区群体和大别山群体的遗传一致度很大，达0.92，首先聚在一起，然后在0.82处与大洪山群体聚在一起。这与6个县市群体的UPGMA聚类结果十分相似，即6个县市群体可明显地分为2大组，第1组为大洪山区的随州和安陆：第2组包括其它4个县市群体。在第2组，麻城和红安群体首先聚在一起后与鄂西南山区的巴东群体聚在一起，然后再与同为大别山山区的罗田群体聚在一起。这说明了鄂西南山区群体和大别山群体遗传一致度大，而与大洪山群体遗传一致度较小。