HGR13与SMARCB1蛋白的相互作用及其在细胞周期中的功能鉴定

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:underdog1234
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:通过发现HGR13的相互作用蛋白,探究HGR13的功能;验证HGR13和SMARCB1的相互作用的真实性以及两者相互作用的结构域;根据SMARCB1的功能,探究HGR13的功能(细胞周期)。   为了阐述该课题实验目的,特介绍以下为相关背景:在哺乳动物细胞核内,DNA围绕着组蛋白8聚体形成一个核小体结构。这个核小体结构成为许多跟DNA有关的生物过程的障碍,比如转录和DNA复制,以及DNA修复。核小体结构主要有两类调控者,一类是组蛋白乙酰化/去乙酰化复合体(HATs/HDACs)---这些复合体能够在和小体组蛋白的N-端进行乙酰化,去乙酰化修饰---这一过程至今尚不完全清楚,比较明确的是,乙酰化,去乙酰化直接影响基因的转录。还有一种染色质重构复合体,那就是SWI2/SNF2复合体。这个复合体的核心组分是一个ATP酶(Brg/Brm),它可以依赖ATP水解的能量打开核小体的二级结构。受SWI2/SNF2调节的基因在全基因组散在分布,说明SWI2/SNF2复合体调节基因活性的方式不是打开某一区段很大的染色质结构---例如巴式小体或者染色质上的异染部分,而是随时并且随机调节各个基因所在染色质的结构的。也就是说,SWI2/SNF2其实更像是转录调节蛋白。SWI2/SNF2复合体除了DNA依赖的ATP酶(Brg/Brm)以外,还有一个核心组分,就是SMARCB1。这个组分含有DNA结合结构域,并且含有Rpt1,Rpt2两个蛋白相互作用结构域,负责与多种转录因子相互作用。基因的表达调控是细胞内最重要的事件,细胞内某一大分子的有无,或者量的变化,直接导致细胞的质变。细胞因此而或增殖,或凋亡,或分化,或脱分化,或休眠,或活跃。   在上世纪90年代,大规模cDNA文库测序大大推动了基因研究。人HGR13就是在胎脑CDNA文库中随机测序得到的,这个基因定位于Xq22;根据其与小鼠HGR13基因家族成员的同源关系,命名为hHGR13[3]。人hGR13基因的表达产物是一个125aa的蛋白质。人hGR13基因定位在22号染色体的q臂,也就是X染色体短臂上,它在脑中表达很高,所以后来被命名为Brain expressed X-linked protein,再后来的研究中,发现这个蛋白跟HGR74是同源蛋白。HGR的命名源于---人生长因子受体相关蛋白,但实际上,韩春雨等人研究发现,这个蛋白跟人HGR74的功能相去甚远。HGR74主要表达在细胞浆,而HGR13主要表达在细胞核。HGR74的相互作用蛋白是生长因素受体,而HGR13主要的相互作用蛋白是转录因子。HGR74的功能从目前来看,主要是信号转导,而HGR13的功能似乎主要是转录调节。但根据命名原则,定名为HGR13。13主要是指这个蛋白大约13KD。   对人HGR13蛋白进行生物信息学分析表明,HGR13分子量约为13kDa。此蛋白在人的脑和睾丸中有很高的表达,在其他器官,如肺,肾等部位,也有少量表达。从目前的数据库来看,HGR13不存在明显的功能性结构域,C端具有一个富含亮氨酸的出核信号。我们对HGR13进行的亲疏水性分析表明,该蛋白没有大段的疏水区段,所以不可能是膜蛋白。软件分析(P-SORT)其细胞亚定位表明,HGR13有60%的可能性定位于细胞核,40%的可能性定位于细胞浆。没有其他细胞器的定位可能性。因此,我们推测,这个蛋白可能是一个位于细胞核的小分子,根据其亚细胞定位我们推测,HGR13蛋白可能和基因的表达调控有关。   本研究以HGR13为“诱饵”,应用酵母双杂交筛选与HGR13相互作用的蛋白,以期探究HGR13分子的功能。本研究发现,表观遗传相关蛋白SMARCB1是HGR13的相互作用蛋白。   方法:酵母双杂交筛选与HGR13的相互作用蛋白;体外GSTPull-down以及亚细胞定位分析实验验证其相互作用的真实性;细胞流式分析这一相互作用对细胞周期的影响。   结果:本文以HGR13为“诱饵”蛋白,应用酵母双杂交系统筛选HGR13的相互作用蛋白。我们的研究发现, SMARCB1直接且特异的与HGR13相互作用。 SMARCB1是染色质重塑复合体SWI/SNF的核心组分。SWI/SNF最初在上世纪90年代发现于酿酒酵母中, SWI/SNF染色质重塑复合体是表观遗传分子机制中的重要一员;SWI/SNF的发现,揭开了人们对表观遗传学研究的热潮。SWI/SNF复合体的核心作用是依赖ATP水解的能量打开核小体结构,这样就使转录因子等基因调节蛋白得以接近DNA;所以,它的核心组分是ATP酶。除此之外,SWI/SNF还有一个重要的核心组分就是SMARCB1,SMARCB1负责与多种转录调节蛋白结合。在几乎所有真核生物中,都发现有SMARCB1蛋白,可见其非常重要。SMARCB1有两个反向重复结构区域,即Rpt1和Rpt2。这两个结构在进化中的保守性更高。Rpt1和Rpt2是结合各种蛋白的结构平台。   我们的研究表明,HGR13与SMARCB1具有直接并且特异的相互作用。我们根据SMARCB1蛋白的结构域构建了一系列的缺失突变体对HGR13进行相互租用分析,结果表明表明SMARCB1的Rpt1和Rpt2是HGR13的结合结构域。应用激光共聚焦显微镜分析亚细胞定位显示,HGR13与SMARCB1都主要分布在细胞核之中,这表明二者之间的相互作用的功能可能参与基因表达调控的过程。本文进一步对HGR13与SMARCB1之间的相互作用的功能进行了进一步的研究,发现HGR13通过与SMARCB1的相互作用影响细胞周期。   结论:   1、HGR13是HGR13蛋白家族中与SMARCB1特异相互作用的蛋白。   2、HGR13蛋白定位于核内。是一个存在于细胞核的小分子,它的功能是介导分子间的相互作用并和基因的表达调控有关。人HGR13是通过与SMARCB1相互作用调控细胞周期的。
其他文献
A group of G.hirsutum L.varieties and theirhybrids F_1 were studied on two fields withdifferent mineral supply conditions:optimalmineral supply and without fer
期刊
期刊
可控硅实质上就是一个单方向导电的快速无触点开关。一个性能良好的可控硅每秒钟可以开关2.5万次,速度之快,是一般有触点开关所不能比拟的。我们应用可控硅这个快速开关的性
目的:(1)探索神经变性疾病(NDD)患者脑脊液(CSF)诱导人间充质干细胞(hMSCs)定向分化为神经干细胞(NSCs)的可行性,并观察、比较不同诱导剂(CSF、生长因子)诱导不同来源间充质干细
期刊