随着我国经济的高速发展，城市化水平逐渐提高，城市交通拥堵问题日益突出，传统的交通系统已无法满足城市发展以及居民出行的需求,因此，发展具备速度快、运量大、污染少、效率高的轨道交通项目就成为城市缓解交通问题、构建综合交通体系的重要项目。但是，作为准公共产品，城市轨道交通具有巨大的正外部性。从各大城市城市轨道交通的发展状况来看，除香港、东京等少数几家盈利外，都处于政府补贴的状态。本文从经济学的角度对这些外部性进行了分类分析评估和内在化对策研究，以期实现城市轨道交通外部效益内在化以及城市轨道交通供给的良性循环。首先，根据外部性理论将城市轨道交通外部性分为正外部性和负外部性，并进行深入分析；其次，科学选取可量化指标并构建合理的综合评价体系，运用有无对比法和支付意愿法对城市轨道交通的正、负外部性进行定量分析；然后，用长沙地铁2号线一期工程进行实证分析，得出城市轨道交通的正外部性远大于负外部性，并进行综合效益评价。本文通过对城市轨道交通外部性的研究，阐述了运用外部性内在化理论实现外部效益内在化的作用，并探讨了内部化的方法，提出了城市轨道交通外部性内在化的三种对策：政府方案-庇古税、市场方案-科斯产权交易内在化理论、企业合并方案，对于加强城市轨道交通投资，加速城市轨道交通建设有一定的促进作用和现实意义。