水飞蓟属菊科,是一年或两年生草木植物,耐寒冷、干旱、盐碱及土地贫瘠,适应性较高,对土壤要求不严。水飞蓟籽实入药,其活性成分具有抗氧化、调节免疫、保护肝脏等多种作用,是治疗急慢性肝炎、肝硬化的良药;同时,其籽仁可以用来榨油,籽粕可以喂养牲畜,是兼具药用、油用、饲用等多种功能的药用植物,也是特殊的经济作物,适合进行规模化种植。研究表明,在植物生长过程中,可通过喷施外源脱落酸（ABA）等植物生长激素对干旱胁迫加以缓解,降低对植物的损害。因此,本论文通过不同浓度的外源ABA处理,研究其对水飞蓟种子萌发及幼苗生长发育的影响,为揭示外源ABA缓解水飞蓟干旱胁迫的响应机制奠定基础,为今后水飞蓟在抗旱育种及实际栽培中提供理论依据。1、通过不同浓度聚乙二醇（PEG）（ck、5%、10%、15%、20%）模拟干旱梯度。在不同程度的干旱胁迫下进行ABA（a1、a2、a3、a4、a5）浸种处理,研究外源ABA对干旱胁迫下水飞蓟种子萌发的影响。结果得:在5%PEG、10%PEG模拟干旱胁迫下,a4处理下水飞蓟种子生长发育效果较好;在15%PEG模拟干旱胁迫下,a2处理下水飞蓟种子生长发育效果较好,在20%PEG模拟干旱胁迫下,水飞蓟种子不再萌发。2、叶片喷施不同浓度ABA（ck、200 mg/L、400 mg/L、800 mg/L）,在干旱0、3、5和10 d分别取样,测定生理生化指标。结果得:400 mg/LABA处理后水飞蓟幼苗叶片中叶绿素含量、可溶性糖及抗氧化酶系统活性均出现显著提高。同时,该处理下丙二醛（MDA）含量有所下降。3、通过DESeq分析方法检测出S＿C vs S＿D共238个差异表达基因,其中129个基因表达上调,上调数比下调数多20个;检测出S＿D vs S＿DA共641个差异表达基因,其中286个基因表达上调,下调数比上调数多69个;检测出S＿C vs S＿DA共983个差异表达基因,其中505个基因表达下调,下调数比上调数多27个。4、通过差异表达基因的GO富集和KEGG富集研究,发现S＿C vs S＿D、S＿D vs S＿DA和S＿C vs S＿DA三组间互比后,生物学过程被富集,在植物激素转导和MAPK信号途径上被明显注释。通过S＿D vs S＿DA与S＿C vs S＿D的KEGG富集分析,结果得:施用ABA后注释到前五条富集通路上的差异基因:SAUR基因、GH3基因、TGL基因和TPS基因的转录活性都受到抑制,GPAT基因转录活性上升。