分子马达是一类将ATP分子中的化学能或离子化学势直接、高效的转换为机械能，并产生协调的定向运动而做功的蛋白。作为分子马达中的一员，DNA 解旋酶参与了包括DNA复制、修复、重组、转录及翻译在内的重要生命活动，因此对解旋酶的研究具有重要现实意义。此外，多个分子马达共同运输货物在细胞生命活动中扮演重要的角色，可使货物的速度和运输距离增加，因此对多马达协作运输的研究有重要的意义。 本文主要研究内容如下： 1. DNA 自由能对解旋速度的影响：（1）在DNA 一端加外力，DNA 自由能的减少等于外力与DNA 单链位移的乘积。随外力增加，解旋酶的解旋速度明显增加。（2）阳离子浓度增加使DNA 分子磷酸集团的静电作用减弱，使解旋速度降低。钠离子浓度的增加使解旋酶的解旋速度下降，镁离子在较高和较低浓度时都抑制解旋酶的解旋速度。 2.依据解旋酶的解旋过程，将其相互作用由非对称势来描述。ATP水解提供能量和外界涨落的影响视为噪声，以朗之万方程为基础进行模拟。结果表明随噪声强度增加，解旋速度也增加。 3.运输货物的多个分子马达处于共同化学态时，本文得到了货物速度所满足的朗之万方程及货物运输距离的主方程，结果表明随分子马达个数的增加，货物的速度及其运输距离与马达个数成正比。