猪IGFBP6和CYR61基因片段的克隆、定位、多态及组织表达谱研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:calidaw
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IGFBP6(insulin-like growth factor binding protein 6)和CYR61(cysteine rich angiogenic inducer 61)是IGFBP超家族的成员,能与胰岛素样生长因子(IGFs)结合,调节IGFs与其受体(IGFR)的结合能力,从而调节机体生长发育和代谢。本课题将其作为影响猪生长发育的候选基因进行研究,通过对其基因片段克隆、染色体定位、组织表达谱分析、原核表达、多态位点检测及其与相关性状的关联分析,为进一步研究该基因对猪生长发育和脂肪代谢的作用机制打下基础,并为猪标记辅助选择提供候选基因。主要研究结果如下: 1.依据人cDNA信息,应用生物信息学及比较基因组学策略,以获得的猪EST重叠群来设计猪特异引物,克隆出猪IGFBP6基因片段和CYR61基因片段,并获得猪IGFBP6基因cDNA编码区全长序列。 2.利用体细胞杂种板和辐射杂种板分别对猪IGFBP6基因和CYR61基因进行染色体区域定位,将PCR分型数据提交到在线数据分析软件进行统计分析。结果表明,IGFBP6基因定位于猪5p11-p15(与SW439紧密连锁,LOD=10.14),CYR61基因定位于猪4q21-q24(与SW1461紧密连锁,LOD=5.43)。 3.利用RT-PCR法,检测了成年长白母猪的心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪、胃和小肠组织,以及长大小公猪的心、肝、脾、肺、肾和肌肉组织中猪IGFBP6基因和CYR61基因的组织表达谱。结果表明,IGFBP6基因在上述组织中均有表达,在母猪脂肪组织和小猪心脏组织中表达量相对较高,CYR61基因在小猪心脏组织中表达最高。 4.应用测序和PCR-RFLP方法,发现猪IGFBP6基因第4外显子Taa Ⅰ-RFLP(T-C)存在多态位点,分析了不同群体中该碱基突变位点的多态性,计算了该位点在10个猪品种中的基因型和基因频率,比较了各基因型在不同猪群的分布差异。研究发现,该位点在国内外猪品种中具有丰富多态性。 5.检测了通城猪、长白猪、大白猪、大长通猪和长大通猪(华中农业大学动物分子生物学与育种实验室与通城县畜牧局共同组建的试验群体)IGFBP6基因第4外显子Taa Ⅰ-RFLP(T-C)位点的多态性,利用SPSS 11.5中的广义线型模型,初步分析了该基因与部分生产性状和生化指标的关联。结果表明,该基因第4外显子突变位点与猪胸腰椎膘厚、肌肉失水率和促甲状腺素的含量显著相关(P<0.05)。 6.构建了猪IGFBP6基因重组原核表达载体pET-28a-IGFBP6,利用SDS-PAGE检测,该重组原核表达载体成功表达了猪IGFBP6蛋白。
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