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本研究从感染根结线虫的番茄根系中分离到46个细菌菌株，NA平板初筛获得13个抑制青枯雷尔氏菌生长的拮抗菌株，其抑菌圈宽度达7.1～26.3 mm，同时测得其中12个菌株对多种植物病原真菌有不同程度的抑制作用。温室试验表明，菌株EN5、EN15、EN01和EN16对青枯病的抑病效果最为显著，平均防效分别为70.82％、89.54％、85.38％和78.81％；而EN5、SW1和SB2能有效降低番茄根结线虫病的根结指数，抑病效果均达49％。同时测定了这些菌株对青枯病菌—根结线虫复合病的防治效果，结果表明，EN5、SW1和SB2能显著降低复合病害的病情指数，其中SW1的防效最佳，青枯病指数比对照下降56.66，根结指数降低5.21。自然土中重复测定EN5等7个菌株对青枯病和复合病害的抑病作用，其中菌株EN5、EN16、SW1和SB1的抑病效果较为稳定。通过形态和生理生化特征初步鉴定，菌株EN5、EN15、EN01、SB1、SB2和SW1等6个菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)，而EN16为短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)；16S rDNA序列分析进一步确定菌株EN5为枯草芽孢杆菌内生亚种(B．subtilis subsp．endophyticus)。对菌株EN5、EN16、SW1和SB1防治番茄青枯病的作用机理进行分析，结果表明，菌株EN5处理番茄后20d，在番茄根茎部有较高定殖量(达3.60×10~4cfu／g·FW)，该菌株胞外液无抗菌活性，其抑病效果仅13.56％，菌体抑病效果则高达71.19％，因此推断其作用机理是以菌体的定殖竞争作用为主；菌株SB1胞外液的抗菌活性相当显著，其抑病效果达50.85％，而定殖力明显弱于其他三个供试菌株，诱导试验中防效较差，由此推测其抑病作用主要依赖于胞外液的抗菌活性；SW1和EN16胞外液的抑病效果分别为22.03％和27.12％，远低于其菌体的抑病作用，同时两菌株具有较好的定殖力，说明抑病作用与其菌体的定殖力有关，此外，诱导抗性试验表明两菌株能有效地诱导番茄抗青枯病，诱发过氧化物酶(POD)、多酚氧化酶(PPO)和苯丙氨酸解氨酶(PAL)等抗病相关性酶活性的显著增强，因此，诱导抗性是它们的主要抑病机制之一。以电镜观察法进一步分析菌株EN5在番茄根茎组织中的分布，结果显示，EN5主要分布于主根基部及茎部的韧皮组织、细胞间隙等部位。盆栽试验分析EN5菌株在不同土壤条件、不同接种方式及不同作物中的定殖力，结果表明，菌株EN5在自然土和灭菌土条件下均能稳定地定殖于番茄植株；浸种、浸根和灌根处理条件下，以灌根法的定殖效果最佳；在番茄、烟草和黄瓜体内均可定殖，其中在番茄和烟草体内的定殖量较大。菌株EN5对番茄体内及土壤中微生物种群影响的测定结果表明，EN5处理后，植株内3类主要微生物种群数量明显减少，而土壤中微生物种群在处理初期有所减少，处理后期则多数微生物群体，尤其是氨化细菌、固氮菌等生理微生物群体数量显著增多，此外，ERIC-PCR结果也表明，EN5的处理还对根围土中微生物的种类产生一定的影响。菌株EN16和SW1灌根处理后2～10 d内挑战接种青枯病菌，均能有效诱导番茄对青枯病的抗性，其中以间隔期为7～10d诱导效果最好，与此结果相符的是，POD、PPO和PAL的酶活力在7～10d时也达到较高值。以灌根和浸种法接种菌株EN16和SW1，灌根处理可有效诱导番茄产生抗病性，浸种处理诱导效果较差。盆试测定菌株SW1和EN16对烟草花叶病毒病的诱导效果，结果表明，菌株SW1的诱导效果优于菌株EN16；病程相关蛋白结果进一步说明菌株SW1可以诱导烟草叶片中多种PR蛋白的大量积累，其诱导蛋白谱与乙酰水杨酸的有较大一致性，而EN16诱导后PR蛋白积累量较小，与乙酰水杨酸的不完全相同。诱变试验表明，菌株SB1的抑病作用与其胞外液的活性呈正相关性。为了提高胞外活性物质的产量，对多种培养基进行筛选，结果表明，葡萄糖和矿物质可以促进活性物质的分泌。对抗菌物质理化性质的分析表明，SB1分泌的抗菌物质对热稳定、对紫外线和蛋白酶有较好的耐受力，具有水溶性和脂溶性特点。采用柱层析和高效液相技术，分离并鉴定了PD培养上清液中的抗菌成分为表面活性素，PCR技术检测SB1菌株中的抗菌素基因，结果表明，SB1菌株中的表面活性素合成基因srfA与报道序列(BACSRFAB)同源性达98％，菌株中伊枯草菌素合成基因ituB与报道的伊枯草菌素A的序列(AB050629)同源性达97.2％。进一步用电镜观察、紫外光谱扫描和SDS-PAGE分析SB1菌株抗菌成分对青枯病菌的拮抗机理，结果显示，处理后细菌胞质浓缩，细胞裂解，DNA呈现明显的增色效应，同时胞内和胞外蛋白质的表达量均受到了影响。以含有抗菌素基因的质粒为模板，PCR合成表面活性素(surfactin)、伊枯草菌素(iturin)和抗菌蛋白TasA的地高辛标记探针，采用斑点杂交技术对24个菌株的相关基因加以检测，并用竞争ELISA法分析阳性样品中表面活性素基因的表达情况。结果表明，以阳性质粒为模板，获得1200 bp、1479 bp和790 bp的3个特异性探针，其检测灵敏度分别为2、20和0.1 ng；从24个菌株中检测到10份样品含有表面活性素合成相关基因，10份样品含有伊枯草菌素合成相关基因和4份样品中存在tasA基因；ELISA结果表明，从10份阳性样本的KMB发酵液中均检测到表面活性素，其中菌株EN1和SB1的产量较高，达32.9 mg／L和41.0 mg／L。