益母草（Leonurus heterophyllus Houtt.）系唇形科（Lamiaceae）益母草属植物。一年生或两年生草本，全草可入药。主要分布在苏联、朝鲜、日本、热带亚洲、非洲以及美洲各地。我国大部分地区均有分布，生长于多种生境，尤以阳处为多。目前关于益母草遗传多样性的研究主要是借助RAPD、AFLP、ISSR等分子标记展开的。但是关于益母草SSR引物的开发的报道尚未见到。而用SCoT标记分析某一地区益母草种质资源遗传多样性的研究也未见报道。本文利用磁珠富集法，SCoT-银染技术，UPGMA聚类分析方法，从基因组DNA扩增多态性的角度，进行了如下探索：①益母草SSR引物的初步开发；②益母草植物66份材料遗传多样性、亲缘关系及其地理位置关系研究。本文旨在从基因组水平上为益母草植物分类提供科学依据，丰富益母草植物系统学研究的内容，为保护我国益母草种质资源的多样性提供理论依据。主要的研究结果如下：1.对SSR引物进行开发并加以检测。由于开发成功的引物较少，只做了初步分析，此方面的工作需要继续延续，且有必要性。2.借助ScoT这种新型分子标记对来自河南省内的66份益母草材料进行聚类分析。从36个引物中筛选出10对，共扩增得到240条清晰可统计的条带，其中多态性条带为240条，占总带数的100%。所得结果如下：①益母草具有非常丰富的多态性；②聚类结果显示地理距离与亲缘关系的远近有关，但地理距离远近不是主要因素，遗传背景因素起主要作用；③益母草的遗传分化主要存在居群内；④地理距离和遗传距离总体上呈不明显的正相关关系。