我国上市公司独立董事制度的建立，有助于公司治理结构的完善。但是通过实践检验，我们看到，目前的独立董事未能发挥其应有的作用，上市公司仍然存在控股股东滥权严重，侵犯公司和广大中小股东利益的现象。如何完善独立董事制度，使其发挥正常功能，是本文的出发点。独立董事制度源于美英等国，这些国家股权高度分散，管理层占主导地位，属于一元制的治理模式。而我国上市公司股权高度集中，控股股东操纵公司运作，监事会监督不力。这与美英等国的治理环境存在较大差异，因此不能全盘照搬国外独立董事制度，有必要结合我国特殊课题，对独立董事制度加以改革创新，使其适应我国国情，充分发挥作用。国内专家学者关于完善独立董事制度各抒己见，然而进行系统分析的很少。本文创造性的提出“系统性独立董事制度”，其主要内容是指基于系统功能结构理论，从“功能、元素、结构、环境”四方面分析我国独立董事实践现状，发现问题并提出较系统全面的对策。通过分析，围绕着监督大股东和管理层的功能，结合我国“一股独大”和监事会监督不力的现状，参照国外成功经验，本文对独立董事任职资格、选任程序、职权配置和行权保障、配套环境进行了分析和完善，健全了发挥功能的配套机制，使独立董事真正代表了全体股东的利益，尤其是中小股东的利益。