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由茄科雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）引起的植物细菌性青枯病是世界上危害最大、分布最广、造成损失最严重的植物病害之一，至今尚无有效防治办法。不同地区、不同寄主来源的青枯菌菌株在寄主范围、致病力强弱和细菌学特性上并不完全相同。随着分子生物学和测序技术的发展和完善，细菌基因组学研究得到不断的加强和深入，越来越多的病原被测序。目前为止，除小种4号菌株外，青枯菌的其它4个生理小种的测序已经完成或将要完成。为了更深入的研究小种4号菌株与寄主植物姜之间的特异相关性，以及为最终解析小种4号青枯菌的致病特异性及其防治奠定基础，本研究以小种4号菌株SD54为例，对该菌株进行了全基因组测序、比较基因组学以及致病特异性分析等研究，取得的主要结果如下：1．青枯菌小种4号菌株SD54基因组测序及比较基因组学分析（1）利用Illumina (Solexa)和454焦磷酸测序技术相结合的测序方法对SD54进行了全基因组序列测定，并经过Gap填补和序列组装最终获得了SD54的基因组框架图。序列分析表明：SD54基因组大小为5,784,798bp，平均GC含量67%，编码5,496个CDS，56个tRNA和4个rRNA（5s-16s-23s）。（2）通过对SD54和国内外已发表的6个青枯菌株泛基因组学分析，结果显示SD54中共有606个特异基因，这些特异基因将可以用于菌株分类。利用所得数据建立了系统发育树，弄清了SD54菌株进化过程中的亲缘关系，为以后的青枯菌研究奠定了基础。对SD54进行的共线性分析表明，共线性越大，进化关系越相近。进一步的基因预测发现，在SD54中含有6个基因组岛，平均GC含量58%，共包含63个基因，而基因组岛是青枯菌通过水平基因转移吸收的外源DNA，这可能与青枯病菌更加有效地侵染植物寄主和扩大寄主范围有关。将SD54与本研究中其它7个测序菌株和国内外已发表的6个青枯菌强致病力菌株的基因组序列比较分析，发现SD54中存在4个特异基因组区段Scaffold32、Scaffold48、Scaffold75和Scaffold76，其中在Scaffold76的5’端存在特异性的hrpG基因，而hrp基因是青枯菌致病性所必需的，由此推测特异基因hrpG与SD54菌株的致病特异性可能存在相关性。2．青枯菌hrpG基因的突变及其功能分析为了进一步研究hrpG基因功能，构建了hrpG基因重组自杀质粒，并将其电转化至青枯菌SD54野生型菌株中，经过体内同源重组，获得了hrpG基因缺失突变株。hrpG缺失突变株的致病性检测正在进行。