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目的:通过分析吉林省结核分枝杆菌(MTB)耐药情况及相关基因的突变特征,为吉林省结核病尤其是耐多药结核病(MDR-TB)临床药物配比及预防控制策略制定提供重要的技术支持,对控制耐药结核增长率,优化抗结核药物的临床使用,提高治疗成功率、降低复发机率,及促进耐药患者管理等结核病防控具有重要意义。方法:收集2016年1月至2018年9月吉林省各地区送至吉林省结核病参比实验室的MTB,以及菌株来源病例相关信息,共1091例。采用比例法进行药敏试验,包含异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)、乙胺丁醇(EMB)、卡那霉素(KM)、阿米卡星(AMK)、卷曲霉素(CPM)和氧氟沙星(OFX)共8种药物;共83株(耐药43株,敏感40株)进行二线药物耐药基因研究,共研究9个相关耐药基因(rrs、eis、tlyA、gyrA、Rv0148、Rv2005c、Rv2744c、ppnk、bfrB)。计量资料采用)43(±S表示。计数资料用率或构成比表示,采用χ~2检验比较不同特征人群之间耐药比例的差异,采用非条件Logistic回归分析影响耐药的因素,基因片段序列拼接采用DNAstar软件,差异性基因的比较采用MEGA5软件,P<0.05认为差异具有统计学意义。结果:1.总体耐药情况:在1091例MTB中,423株至少耐一种抗结核药物,耐药率为38.77%。初治耐药率35.67%,复治耐药率53.09%;2.各类型耐药情况:一线抗结核药物INH、RFP、EMB、SM的单耐药率分别为3.85%、3.48%、1.28%、9.07%。二线抗结核药物KM、AMK、OFX、CPM的单耐药率分别为1.01%、0.37%、7.06%、0.73%。MDR-TB为10.54%,多耐药率8.89%,XDR-TB为1.74%。对INH、RFP、EBM、SM、AMK、KM、OFX、CPM任何形式耐药率分别为19.62%、17.05%、9.81%、24.75%、3.76%、4.95%、9.53%、3.39%。在RR-TB中MDR占61.8%。耐药顺位:前五位由高到低依次为:SM(24.75%)、INH(19.62%)、RFP(17.05%)、EBM(9.81%)、OFX(9.53%);3.影响因素分析:(1)耐药在病例类型上差异有统计学意义(χ~2=20.385,P<0.001)。(2)病例类型和居住地是MDR的影响因素。复治患者发生MDR的危险是初治患者的3.373倍(OR=3.373,95%CI:2.123~5.119)。居住地是城市的患者发生MDR的危险是农村患者的1.846倍(OR=1.846,95%CI:1.241~2.744)。(3)多耐药结核在年龄上差异有统计学意义(χ~2=15.847,P<0.05)。(4)病例类型和居住地是RR-TB的影响因素。复治患者发生RR-TB的危险是初治患者的3.101倍(OR=3.101,95%CI:2.172~4.427)。居住地在城市的患者发生RR-TB的危险是农村患者的1.409倍(OR=1.409,95%CI:1.013~1.959);4.基因突变情况:(1)rrs基因均为A1401G突变,在AMK、KM、CPM耐药菌株突变率分别为100%、93.33%、87.5%。eis基因在1株敏感菌株发生双位点突变。51株MTB发生Rv2005c基因突变,50株突变位点在第279位C→T,但在耐药和敏感之间无差异。7株MTB发生Rv2744c基因突变。bfrB基因共68株发生突变,共67株检测到在第468位A→G突变,但在耐药和敏感之间无差异。Rv0148基因共在3株中发生了多位点突变。(2)16株CPM耐药菌株中未检测到tlyA基因和ppnk基因突变,在敏感菌株中存在个别菌株突变情况。(3)25株在gyrA基因检测到突变,突变率为78.13%,突变密码子范围为90-100,突变频率最多的是第90和94位,在敏感菌株中未见突变。结论:1.在1091株MTB总耐药率为38.77%,RR-TB17.05%,MDR-TB为10.54%,多耐药率8.89%,XDR-TB为1.74%。2.对四种一线药物的耐药率为37.30%,对四种二线药物的耐药率为13.93%。3.耐药顺位前五位由高到低依次为:SM(24.75%)、INH(19.62%)、RFP(17.05%)、EBM(9.81%)、OFX(9.53%)。4.耐药率在病例类型上有差异,多耐药在年龄上有差异,病例类型和居住地是MDR-TB和RR-TB的影响因素。5.AMK、KM、CPM存在高度交叉耐药现象。AMK、KM、CPM耐药菌株中rrs基因突变率分别为100%、93.33%、87.5%,均发生A1401G突变。6.eis、Rv2005c、Rv2744c、bfrB、Rv0148、tlyA和ppnk基因没有发现可以作为耐药标记的突变。7.OFX耐药菌株gyrA基因突变率78.13%,突变位点主要集中在密码子的第90位、91位和94位。