费氏丙酸杆菌维生素B12生物合成基因的克隆和解析

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维生素B12是一种哺乳动物所必需的维生素,具有广泛的生理学作用,但是哺乳动物自身却不能合成,仅有某些特定的微生物才能合成维生素B12如杆菌,沙门氏菌,丙酸菌和假单胞菌。目前,工业上主要利用脱氮假单胞菌和费氏丙酸杆菌进行维生素B12的生产。由于费氏丙酸杆菌不产生任何毒素,被美国FDA认定为GRAS(Generlly reagard as safe),其发酵过程能耗低,染菌概率小。因此,费氏丙酸杆菌在维生素B12的发酵生产上占据了越来越重要的地位。为了详尽代谢过程,阐明合成途径,迄今为止,人们已经获得了大部分费氏丙酸杆菌维生素B12生物合成相关的基因,但是,应用费氏丙酸杆菌发酵生产维生素B12的生物合成途径仍不明确。本研究以费氏丙酸杆菌为出发菌株,克隆、解析了与维生素B12生物合成相关的部分基因。首先,应用遗传互补法,将费氏丙酸杆菌IFO12424株的染色体基因文库,电击转化到Salmonella typhimurium CobⅢ领域的缺失突变株TT10858中,进行p.freudenreichi CobⅢ领域维生素B12生物合成基因的筛选,结果得到了4206bp的DNA片段,命名为P4。解析结果表明,该片段包含了一个部分的和三个完整的读写框,依次为编码L-苏氨酸-O-3-磷酸盐脱羧酶的cobD,编码腺苷钴啉酰胺(AdoCbi)激酶和AdoCbi-P鸟苷酸转移酶的cobU,负责催化AdoCbi-GDP与α-ribazole连接,完成腺苷钴胺素(AdoCbI)最终合成的cobS,及编码转录调节蛋白的cobR。然后,根据所得cobD的碱基序列,设计相应引物,应用LA PCRTM in vitro Cloning Kit,获得了cobD上游3290bp的序列信息,命名为P3。经序列分析,发现此片段包含了编码钴啉酸a,c-二酰胺合成酶的cbiA、负责传递腺苷将钴啉胺酸a,c-二酰胺转化生成腺苷钴啉胺酸a,c-二酰胺的cobA,催化腺苷钴啉胺酸a,c-二酰胺酰胺化生成腺苷钴啉胺酸的cbiP以及cobD的上游区域。最后,将两者合并后得到全长为7308bp的DNA片段,命名为P7。经ORF检索和同源性分析,发现此片段包含了一个部分ORF和5个完整的ORF,依次为cbiP,cobA,cbiA(cbiA-cobD),cobU,cobS和cobR,它们编码的蛋白负责催化费氏丙酸杆菌发酵生产维生素B12过程中,从钴啉胺酸a,c-二酰胺到最终AdoCbI的生成。因此,发现这些基因为探索费氏丙酸杆菌维生素B12的生物合成途经将具有一定的理论意义。
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