【摘 要】
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目的:筛选及分析缺血性脑卒中（ischemic stroke,IS）患者外周血液中差异表达的微小RNA（micro RNAs,miRNAs）并在此基础上构建IS患者患病风险预测列线图。方法:从公共数据库中获取IS患者外周血液中miRNA和信使RNA（messenger RNA,m RNA）的表达谱。筛选出差异表达的miRNAs（Diff erentially expressed miRNAs,DE
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目的:筛选及分析缺血性脑卒中（ischemic stroke,IS）患者外周血液中差异表达的微小RNA（micro RNAs,miRNAs）并在此基础上构建IS患者患病风险预测列线图。方法:从公共数据库中获取IS患者外周血液中miRNA和信使RNA（messenger RNA,m RNA）的表达谱。筛选出差异表达的miRNAs（Diff erentially expressed miRNAs,DEmiRNAs）和差异表达的m RNAs（Diff erentially expressed m RNAs,DEm RNAs）;然后,预测DEmiRNAs的转录因子（Transcription factors,TFs）;对DEm RNAs进行基因功能注释。接下来进一步构建miRNA-m RNA交互网络和竞争性内源RNA（competi tive endogenous RNA,ce RNA）网络,利用支持向量机（support vector m achine,SVM）模型对网络中关键miRNAs进行筛选并采用实时荧光定量聚合酶链式反应（quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR）的方法对关键miRNAs进行验证。最后,收集临床信息,结合IS患者的临床特征和关键miRNAs的表达,构建了患病风险预测图。结果:1.总共得到了111个DEmiRNAs和501个DEm RNAs;2.DEm i RNAs的前3个TFs是SP1,EGR1和SP4;3.DEm RNAs的GO术语显著富集在中性粒细胞活化、相关免疫以及脱颗粒等,KEGG显著富集在造血细胞系、细胞粘附分子、吞噬体等通路上。4.Mi R-140-3p,miR-34c-5p,miR-330-3p在本研究构建的网络中具有较高的连接程度,处于网络的中心的位置。5.通过构建的列线图可以得出,胆固醇、低密度脂蛋白的含量,患高血压和糖尿病的情况以及miR-140-3p,miR-34c-5p,miR-330-3p的相对表达情况与IS患病情况相关。结论:1.造血细胞谱系、细胞粘附分子、吞噬体和T细胞受体信号等通路是IS发生发展的重要途径。2.Mi R-140-3p,miR-34c-5p,miR-330-3p在IS的发病和进展中发挥重要作用,是预测IS患病风险的新的生物标志物。3.胆固醇以及低密度脂蛋白含量高、患有高血压、患糖尿病、miR-34c-5p、miR-140-3p、miR-330-3p的相对高表达可能是决定患病风险的关键个体因素。
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