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莱芜猪是我国华北地方品种猪，是黄淮海黑猪的典型代表，具有一系列优点：耐粗抗病、繁殖率高、杂交优势明显、哺育力强、肉质细嫩香醇等。多年来，莱芜猪的选种工作多为外貌鉴定加表型选择，缺乏特性基因测定辅助选育，这在很大程度上影响和限制了莱芜猪种质资源的进一步选育提高和利用。同时，由于长期片面追求培育高产的“专门化品系”，忽视了品种资源的保存和利用，使莱芜猪遗传资源受到严重威胁。酰基辅酶A合成酶长链4(Acly-CoA synthetase long chain family4, ACSL4)基因和心脏型脂肪酸结合蛋白(Heart fatty acid-binding protein, H-FABP)基因都与猪肌内脂肪(IMF)的含量显著相关。莱芜猪具有较强的脂肪沉积能力，可能与这两个基因的活性有关。微卫星（Microsatellite），又被称为简单序列重复（simple sequence repeats, SSR）。具有高度的多态性，并且在基因组中含量丰富且分布均匀。因此，是评估地方品种遗传多样性的最适合的分子标记。本研究选取了106头莱芜猪核心群及部分后备猪，用PCR-RFLP的方法分别检测了ACSL4的SNP G2645A位点和H-FABP的HinfⅠ及MspⅠ位点的多态性。并且在106个个体中选出系谱记录完整的56头、13个家系，利用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记评估了莱芜猪群体的遗传多样性，并提出了可行的保种选育措施。研究结果如下：1．在ACSL4的SNP G2645A位点共检测到AG和GG两种基因型，没有检测到AA基因型；G等位基因是优势等位基因；该位点在莱芜猪中呈高度多态。在H-FABP的HinfⅠ位点共检测到HH、Hh和hh3种基因型，该位点在莱芜猪中呈中度多态性。莱芜猪在上述两个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。2．经测序验证，莱芜猪H-FABP（GenBank登录号X98558）基因的HinfⅠ位点的多态性是1324位点T的插入、缺失所造成的。H-FABP的MspⅠ位点在莱芜猪中没有多态性。3．在27个微卫星位点中，共检测到10个高度多态性位点，平均PIC值为0.63；10个中度多态性位点，平均PIC值为0.17；6个低度多态性位点，平均PIC值为0.17；一个没有多态性的位点；观察杂合度从0.07到0.77，总的来说，该群体的遗传多样性偏低。4．为了进一步评估莱芜猪的遗传多样性，我们选了10个高度多态性位点和5个中度多态性位点来进行分析。我们发现该莱芜猪群体存在一定程度的近交和杂合度缺失，但还没有出现近交衰退；所研究莱芜猪群体品种比较纯，不存在与其他品种杂交的情况。综上所述，在莱芜猪本品种选育中，可以顺序选择ACSL4的G2645A位点GG基因型纯合个体和H-FABP的HinfⅠ位点HH基因型纯合个体，提高莱芜猪IMF性状的均一性，将进一步促进莱芜猪种质的保护和利用。在莱芜猪保种工作中，应避免遗传距离较近的家系间的交配，急需建立几个亲缘关系较远的种公猪家系，扩大种母猪群体规模，利用回交等措施增加公猪血缘。