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目的：研究广西扶绥县乙型肝炎(简称乙肝)患者HBV基因型、基因亚型的分布特点,为本地区乙肝的防治、肝癌的防控及临床抗乙肝病毒的治疗提供科学依据。方法：对广西扶绥县肝癌高发区自然人群进行流行病学调查研究,采集空腹静脉血10ml,血清分离后置-80℃冰箱保存备用。建立肝癌高危人群队列。从队列中筛选无临床症状的乙肝病毒携带者245例作为研究对象(HBV DNA病毒拷贝数≥103),进行分析基因型、基因亚型分布的现况研究。同时从队列中筛选肝癌患者40例,采取病例对照的研究方法,将上述245例研究对象作为对照组,分析基因型、基因亚型与肝癌的相互关系。提取285例总研究对象的血清HBV DNA,采用巢式PCR (ntPCR)技术扩增HBV S区基因,经2.0%琼脂糖凝胶电泳,用ABI3730xl基因分析仪进行双向测序。用Chromas Pro 1.21软件进行分析,用DNAMAN 7.0进行序列比对。采用NCBI的在线病毒基因分型工具确定HBV基因型。所测序列与GenBank中获取的S基因区标准的基因亚型序列通过MEGA 6软件进行比对,以Kimura双参数距离法和Neighbor-joining法构建基因亚型树,确定基因亚型。实验数据采用SPSS 22.0统计学软件进行统计分析。结果：(1)在本组285例研究对象中,B基因型59例(20.7%),C基因型223例(78.2%),未分型3例(1.0%)。在肝癌和乙肝病毒携带者中,B基因型、C基因型分别为10例(25.0%)、30例(75.0%)和49例(20.3%)、193例(79.8%)。肝癌与乙肝病毒携带者两组间HBV基因型的分布差异无统计学意义(x 2=0.47,P>0.05)；男性B基因型、C基因型分别为40例(20.2%)、158例(79.8%)；女性B基因型、C基因型分别为19例(22.6%)、65例(77.4%),男性与女性之间HBV基因型的分布差异均无统计学意义((χ2=0.883,P>0.05)；各年龄组间HBV基因型的分布差异均无统计学意义(χ2=0.756,P>0.05)。(2)在B基因型中鉴定出有B1、B2 型,在C基因型中鉴定出有C1和C2亚型,各基因亚型在B、C基因型中所占的比例分别为：B1亚型2例(3.39%)、B2亚型57例(96.61%)；C1亚型210例(94.17%),C2亚型13例(5.83%)。在肝癌中,基因亚型B1、B2、C1、C2、分别为：0例(0)、5例(12.50%)、30例(75.00%)、5例(12.5%)。在乙肝病毒携带者中,基因亚型B1、B2、C1、C2分别为：2例(0.83%)、47例(19.42%)、180例(74.38%)、13例(5.37%)。在肝癌和乙肝病毒携带者两组间HBV基因亚型的分布差异有统计学意义(χ2=3.950,P=0.272),C1与C2两组比较差异无统计学意义(χ2=1.400,P=0.237)。结论： (1)扶绥县HBV基因型以C型占主要优势；HBV基因亚型以C1亚型占主要优势。(2)HBV基因型在肝癌和乙肝病毒携带者两组间的分布差异无统计学意义。(3)HBV基因亚型在肝癌和乙肝携带者间的分布差异无统计学意义,C1、C2两亚型在两组间的分布差异也无统计学意义。