【摘 要】
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目的:DEP结构域蛋白1(DEPDC1)在多种癌组织中异位表达并与患者生存期密切相关,但是它在肺腺癌(lung adenocarcinomas,LUAD)中的表达及作用机制尚不完全清楚。本论文拟分析癌症数据库中肺腺癌相关数据,揭示DEPDC1在正常组织与肺腺癌中的表达情况,以及DEPDC1表达水平与肺腺癌患者生存期的相关性;拟用细胞实验研究DEPDC1调控肺腺癌细胞侵袭、迁移和自噬的作用及机制。方
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目的:DEP结构域蛋白1(DEPDC1)在多种癌组织中异位表达并与患者生存期密切相关,但是它在肺腺癌(lung adenocarcinomas,LUAD)中的表达及作用机制尚不完全清楚。本论文拟分析癌症数据库中肺腺癌相关数据,揭示DEPDC1在正常组织与肺腺癌中的表达情况,以及DEPDC1表达水平与肺腺癌患者生存期的相关性;拟用细胞实验研究DEPDC1调控肺腺癌细胞侵袭、迁移和自噬的作用及机制。方法:(1)肺腺癌中DEPDC1的表达及与患者生存期的关系研究:分析了癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的肺腺癌数据集、Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的GSE75037和GSE31210数据集中肺腺癌与正常组织中DEPDC1表达水平,再使用Kaplan-Meier Plotter分析DEPDC1在肺腺癌中的表达水平与患者生存期之间的相关性。(2)增殖,侵袭和迁移研究:选用DEPDC1高表达的肺腺癌A549细胞株,用小干扰RNA(si RNA)沉默DEPDC1的表达48h,然后用平板克隆实验、Transwell实验和划痕实验,检测DEPDC1沉默对A549细胞的增殖,侵袭、迁移能力的影响。(3)自噬研究:用si RNA沉默DEPDC1的表达48h后,再用自噬抑制剂Bafilomycin A1(100ng/ml)处理A549细胞1小时,最后用Western Blot技术检测DEPDC1沉默对A549细胞自噬分子标志蛋白P62、LC3-B的影响。(4)DEPDC1作用机制研究:a)用Western Blot技术检测沉默DEPDC1对AKT和S6K1磷酸化和总蛋白的影响,以及对基础水平和表皮生长因子(EGF 100ng/ml)诱导的ERK1/2磷酸化和总蛋白的影响;b)用Western Blot技术检测沉默DEPDC1对RAS表达的影响;c)用RAS抑制剂FTS(100μM/L)和ERK1/2抑制剂GDC-0994(25μM/L)处理A549细胞24h后,再用自噬抑制剂Bafilomycin A1(100ng/ml)处理A549细胞1小时,最后用Western Blot技术检测自噬分子标志蛋白LC3-B在蛋白水平的变化以及S6K1磷酸化的改变。结果:(1)对3个不同肺腺癌基因表达数据集的分析结果显示:DEPDC1在LUAD中表达显著上调,与正常组织相比有显著性差异(P<0.05)。(2)使用在线工具Kaplan-Meier Plotter分析DEPDC1与LUAD患者生存期的相关性,结果显示DEPDC1在LUAD中的表达水平与患者生存期呈负相关。(3)体外细胞实验结果显示,敲低DEPDC1抑制A549细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而且诱导A549细胞自噬。(4)生物信息学分析和体外细胞实验研究结果显示:DEPDC1通过上调RAS表达进而激活ERK1/2磷酸化,再进一步激活m TOR,最终抑制自噬。而抑制RAS-ERK1/2信号转导可以诱导A549细胞自噬。结论:(1)癌蛋白DEPDC1在LUAD中呈高表达,并且DEPDC1高表达与LUAD患者生存期呈负相关。(2)DEPDC1可促进A549细胞增殖,迁移和侵袭,并且抑制A549细胞自噬。(3)DEPDC1可以通过RAS-ERK-m TOR通路调控A549细胞的自噬。
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