目的：本研究旨在应用双向电泳结合质谱技术对前列腺增生细胞系BPH-1及前列腺癌雄激素依赖性细胞系LNCaP、前列腺癌雄激素非依赖性细胞系PC-3中差异表达的核基质蛋白进行分离、比较和鉴定,为人前列腺癌组织的NMPs的分离鉴定奠定基础。方法：1、培养BPH-1、LNCaP和PC-3三种细胞并提取其细胞核基质蛋白；2、利用双向电泳结合质谱的蛋白质组学核心技术,分离、鉴定三种细胞系差异表达的核基质蛋白；3、采用Western-blot对差异蛋白进行验证分析。结果：1、完成对三种细胞的培养,成功提取三种细胞核基质蛋白,并找到具有差异表达的29个蛋白；质谱鉴定总共鉴定出28个差异蛋白质。2、选择其中三个蛋白质(hnRNPQ、Annexin A2和GRP78)用Western-blot进行验证。结果显示GRP78在BPH-1细胞系中表达量最高,在LNCaP细胞系中表达量低,而在PC-3细胞系中表达缺失。Annexin A2在BPH-1细胞系中低表达或不表达,在LNCaP细胞系中不表达,而在PC-3细胞系中又重新表达并且表达量增高。未检测到hnRNPQ在细胞中的表达情况。结论：三种前列腺癌细胞系核基质蛋白表达存在显著性差异。GRP78和Annexin A2两种蛋白已证明在癌变中具有重要意义,并有可能成为前列腺癌诊断的候选生物标记物,对前列腺癌的发生发展机理的研究具有提示作用,并能为前列腺癌的诊断治疗和抗癌药物的研究提供新的靶向性蛋白,具有重要的实践意义。由于hnRNPQ相关文献报道较少,尚不可作出相关的预测和评价,有待今后进一步研究。