当今,癌症被认为是全球发病率和死亡率普遍较高的人类复杂疾病之一。在癌症形成和发展过程中,癌症关键基因起到至关重要的推动作用。由于癌症本身的复杂性、发病原因的多样性以及现阶段实验手段的局限性,使得精确识别癌症关键基因成为一个亟待研究解决的难题。目前人们普遍使用全基因组基因表达谱识别单一类型癌症的生物标记物和治疗靶点,但识别多种类型癌症的生物标记物和治疗靶点的研究工作甚少。针对上述问题,本文基于基因表达谱和生物分子互作网络构建一种系统生物学模型,用于分析泌尿生殖系统中肾癌、前列腺癌和卵巢癌的关键基因。从GEO数据库中下载微阵列数据GSE36895、GSE46602和GSE14407,用R语言的Limma包筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。采用 DAVID 数据库对 DEGs进行功能和通路富集分析,应用BioGRID数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络(Protein-protein interaction,PPI网络),随后对PPI网络进行皮尔逊相关性分析,最后有效识别三种泌尿生殖系统癌症的关键基因。通过对三种癌症基因表达谱的比较分析,本文挖掘出三种癌症的潜在基因,并在泌尿生殖系统水平上发现了这些基因的显著富集通路,包括细胞粘附、p53信号、趋化因子信号转导通路、细胞外基质受体和细胞周期的显著异常途径,卵细胞减数分裂,免疫和炎症反应过程等。这有助于为今后癌症的诊断和治疗提供潜在的靶标。