政府绩效审计是围绕着经济性、效率性和效果性对政府部门行政管理活动进行的评价。通过政府绩效审计可以提高政府部门的行政效率，促进政府部门管理体制的改革。政府绩效审计是政府审计发展的必然趋势，政府绩效审计实务既是理论研究的目的，也是一个国家政府绩效审计发展是否成熟的标志。我国自2003年开始实施以实践为主的政府绩效审计试点探索，这些探索从实践上检验并丰富了政府绩效审计理论，为我国全面推进政府绩效审计打下坚实的基础。政府绩效审计方法是实现政府绩效审计目标的方式和手段，审计方法在政府绩效审计实践中具有重要的意义。指标体系法是政府绩效审计人员在实践中为评估政府绩效而普遍使用的方法，但是这种方法的理论研究还很不足，指标体系法科学化研究也存在着不足，这都会制约着政府绩效审计实践的发展。因此，指标体系法的研究对于审计方法理论的完善和实践的应用具有十分重要的意义。本文以绩效审计人员实务中普遍使用的指标体系法为研究对象，首先以规范分析的方法对指标体系法在政府绩效审计中的应用进行理论上的完善，其次以实证分析的方法对指标体系法在政府绩效审计中的应用进行实践上的完善。相关性分析是研究指标设置科学性的重要方法，通过对指标体系中指标之间相关性的实证结果来完善指标体系，使指标体系法更具有科学性，为方法在政府绩效审计中的应用提供依据。