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精神发育迟滞(Mental Retardation,MR)是一种严重影响儿童和青少年健康的神经精神类疾病。非特异性精神发育迟滞(Non-Specific Mental Retardation,NSMR)是一种常见的MR类型,其特点是智力障碍和适应能力明显受损。遗传因素是NSMR的主要病因之一,患者往往表现出明显的家族聚集性。遗传突变检测和致病基因筛查研究发现,微管相关蛋白9(Myotubularin-related protein 9,MTMR9)基因的错义突变可引起NSMR发生,提示该基因的遗传变异可能与NSMR密切相关。为了探究MTMR9基因与人类NSMR的相关性,本研究在来自中国秦巴山区的258 NSMR家系、721个个体中,分别用限制性片段长度多态(RFLP)、单链构象多态(SSCP)和Sanger测序相结合的方法,检测了MTMR9基因序列上的7个单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphism,SNP)的遗传多态性。然后采用基于家系人群的关联分析的方法(Family-Based Association Test,FBAT)分析了MTMR9基因遗传变异与NSMR的相关性。本研究的统计量也由Quanto 1.2.4软件根据样本量、样本结构和等位基因的频率估计。本研究发现,3个SNP rs4559208、rs2164273、rs7815802的等位基因在秦巴山NSMR家庭成员之间存在显著的传递偏倚现象(显著性检测结果分别为:z=1.926,p=0.041;z=2.811,p=0.005;z=2.360,p=0.018),其等位基因G、G和C更倾向于由携带/患者父母传递给患儿。由三个SNPs位点所组成的单倍型在人群中的传递也呈现出与单位点相似的趋势(Chi2(4)=8.835,Global p=0.065)。其中G-G-C单倍型在患者家族成员中表现出过度传递(z=2.505,p=0.012),该单倍型携带者的NSMR患病风险显著高于其他类型人群(OR=1.462,95%CI[1.01~2.09],p=0.04)。三个位点两两形成的单倍型分析也获得一致结果。依据本研究的样本量(家系个数)、样本结构和等位基因频率数据,Quante 1.2.4分析显示本研究结果具有理想的统计学力度(statistic power>93%)。本实验结果说明,MTMR9基因的遗传多态性与中国汉族人群的NSMR具有相关性,该基因的遗传变异或突变可能会引起个体发生不同程度的NSMR。因此,对于病因尚不明确的NSMR患者,开展MTMR9基因的突变检测工作对患者的临床诊断、病因分析以及后期预防和矫治很有必要。