兩漢經學於中國學術及文化有根本性的影響,而其又以今古文經學爲核心內容。近代以來,學者自經學門戶、疑古辯僞等立場於兩漢今古文經學有大量系統論說,但彼此間觀點出入較大,而且多有偏頗及矯枉過正之處。其後學者漸能歸於平正,不過很快因學術視野、問題的移換,使此學大爲蕭索。雖相關研究不絕,卻尚多有歧異之說,仍有待於系統清理。又戰國古文字資料的大量發現,又爲重新檢視漢代今古文經學帶來了契機,而當時古文及古文經的文本性質亦隨之可得較爲精確的認識。西漢五經重現於世,並漸爲官方推崇,而武帝更以其政治需求及理想將之尊立博士於學官。魯恭王壞孔子宅於壁中發現古文經傳,以通行文字所書之經傳遂被以今文之名,不過尚無今古學派之對立,僅有官私學之分,而且其間經傳屬性處於流動的狀態。宣帝時今文博士官學的格局基本成型,其後僅略有增損。而古文經學緣起於孔壁古文經傳的發現及河間獻王對古文舊書的搜求,不過當時主要屬於私學範疇,於古文經學之成立並無必然內在邏1關聯。至成帝時,劉歆因校理秘書見古文《春秋左氏傳》的直接契機,遂於哀帝即位後便欲立《左氏春秋》《毛詩》《逸禮》及《古文尚書》於學官,初擬了古文經學體系。平帝時王莽秉政,於是正式立古文四經於學官。《周官》因有助於王莽篡政,遂於其居攝時亦被尊立學官,正式納入於五經系統,而古文經學一派由此真正成立。光武時因王莽故,學官古文諸經原則上皆應被罷黜,而《左傳》可能因其顧及武力功臣的意願並經數次辯難後而暫立學官。而費氏《易》當時仍屬私學性質,後因古文學者傳習日久,後亦漸被納入古文經學系統,補足五經之缺失。至於今古文經學之間的糾葛,當首先從文字、文本與學派三個層面辨明其名實。今文本初皆爲古文,古文本亦轉寫作今文,但今古文兩派並非由相應的文本直接衍出,而是有很大流動性及偶然性。而今古文兩派經學間有數次爭論,不過並非遍及群經的嚴格對立,彼此內部亦頗有異同。今古文經學文本及學術特徵等亦頗有研究空間。《毛詩序》的結構及其與《毛傳》的關係等被系統考察後,可知其當分爲“古序”“續序”兩部分,而後者撰成於《毛傳》之後。《後漢書》對衛宏所撰《詩序》有“善得《風》《雅》之旨”的評論,對比“續序”與相應《毛傳》所釋詩旨,並結合衛宏學術淵源,似可推定其即爲“續序”作者。而《書序》實出於孔壁古文,今文之序則可能是兒寬師從孔安國時節取今文經相關部分,又置於歐陽《尚書》之尾而流傳,並被載入漢石經。至於孔壁所出古文《尚書》,據《說文》及三體石經所載相關古文,並得清華簡《保訓》參證,可確知其齊魯文字的屬性。古文《尚書》遺字中,還頗有存留古體的現象。武威漢簡《儀禮》用字習慣多與當時通行文字相合,又爲郡國文學弟子所傳習,當屬今文異本無疑。其篇目次序特徵與后倉經本較爲相符。今古文學學術特徵等問題中,藉由對“素王”“革命”等命題之考察,可知西漢今文齊學得於孟子爲多。魯學則更爲純篤,無論所傳習經傳抑或治經形式均與古文經學有相當的親緣性。而今文經學語言獨具一格,喜用諧音雙關的修辭法,其詮釋文字亦多不循字理,藉以宣達經說。又孔壁中書的埋藏年代約在《呂覽》（前239）成書與秦焚書（前213）之間。孔壁中有《春秋》,由藏書之理及劉歆之文可以推知。此外,章句由最初的斷句符號逐漸演變爲一種解釋文體,並於宣帝時被確立爲官方指定解經形式,其後又被拓寬應用範圍。今古文兩派經學雖無貫徹始終的嚴格對立,但亦有系統性的差異。文字方面,今古文已不單純爲歷時性的區別,而更多處於一種流變狀態。文本層面,如篇數、章句等兩派皆有異同。而經文、經說中的典章制度及思想命題等方面,纔是今古文兩派之根本差異所在。不過由於兩派所據經典多同,其學說自然也頗有相合之處,而且不乏互採者,所以這種所謂差異有其限度。