《财政“十二五”规划》实施以来,国库集中支付改革积极贯彻,较大的提高了财政办公效率。在我国,很多省份依旧采取传统的处理模式,面对大量手工纸质数据,人为主观因素较大,数据容易出错、篡改,影响数据安全性,降低工作效率。针对以上问题,必须利用现代化技术手段,实现信息的电子化管理,积极推进信息化建设,消除安全风险,提高工作效率。国库集中支付制度作为政府在财政领域进行改革的一项重要措施,从根本上改变了财政资金的拨付方式和管理模式,它将琐碎的拨付过程转变成电子信息方式的拨付,使财政资金的运转更加高效而透明化,在很大程度上减少了政府资金的应用成本,保证专款专用落到实处,并坚决抵制专项资金被占用、截留和挪用等违法行为。财政国库集中支付电子化对财政资金的安全性、完整性都能满足,并且工作效率也可以得到提升。2001年我国开始实施国库集中支付电子化改革,其依据信息化数据,提升了运行效率,筑牢资金安全防线,进一步提升了国库管理水平。信息化和大数据的不断完善,使国库集中支付电子化已成为财政事业发展的大势所趋,这既是财政管理创新的内在要求,也是转变财政管理方式的重要途径。因此,本文选取作者任职的Z公司国库集中电子化项目为研究对象,运用科学的管理学方法具体从组织结构方面充分分析Z公司目前国库集中支付电子化项目运营管理的优缺点。分析表明,Z公司组织结构方面存在组织管理灵活性差、完整性被分割、资源配置不当、运作流程效率低等问题,结合Z公司实际发展情况和具体的组织结构问题,本文提出了组织结构优化方案及配套措施,帮助Z公司突破发展困境,实现可持续、有序发展。针对以上优化,取得了一定的效果,Z公司在优化后人员从970人精简到852人,人力节约118人,并且相应的人力总成本节约了692人,但人均成本并没有降低,依旧是4.38。整体来看优化后服务性增强,创新性增强,规范性增强,不仅提升了公司业绩,还拓宽了公司的业务范围,使Z公司获得了持续的竞争优势。希望本文能对像Z公司这样的企业有所启示。