新一代测序技术在唾液腺恶性肿瘤中的相关研究

来源 :中国人民解放军医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qqwd1
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第一部分 研究唾液腺透明细胞肉瘤存在NBN基因体细胞错义突变目的寻找唾液腺透明细胞肉瘤(CCS)基因组变异,筛选致癌基因,为CCS发病机制奠定基础。方法应用全外显子组测序分析CCS患者的肿瘤标本中可能存在的基因突变。利用Sanger测序验证患者外周血液及瘤旁组织中是否存在可疑基因突变。结果全外显子组测序以及Sanger测序验证结果显示在本例CCS中存在体细胞错义突变c.1061C>T(p.P354L),其突变位点为NBN基因的第9个外显子。结论:本例CCS存在NBN上c.1061C>T(p.P354L)体细胞错义突变。该突变的结果是脯氨酸转化为亮氨酸(p.P354L)导致NBN的有害突变。第二部分 高通量测序研究黏液表皮样癌伴肺肌上皮癌转移的遗传机制目的寻找黏液表皮样癌伴肺性肌上皮癌转移的致癌基因,结合免疫组库为精准靶向治疗提供位点。方法选取患者肿瘤标本,①通过外显子测序找到癌变的致癌突变,并且进行-验证、注释和突变的功能预测。②通过全转录组测序找到差异表达的基因集,并进行基因功能预测和通路注释。③通过免疫组库找到患者异常的免疫细胞分子标记,并进行免疫组库与基因突变的关联分析。④通过多系统生物信息分析,深入研究该病的发病及转移机制,并结合免疫组库,寻找药物靶标。结果①外显子测序诊断结果,患者的Driver mutation gene (驱动突变基因)按照致癌的可能性从大到小排序分别为:WNT3, LNC, CCNE1, LC5A4等。②CCNE1基因的表达由癌旁的0.449353809上调到癌组织的1.411029095。该基因具有一个特异性靶向药物:ALISERTIB。结论CCNE1基因突变极可能是此病例的致癌原因,CCNE1基因有一个特异性靶向药物:ALISERTIB。
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