两株新种微生物的多相分类学研究

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本课题的研究重点是对从贵州省仁怀市茅台镇赤水河水样中分离出的两株菌种CHY01和GSA152进行多相分类学鉴定。通过形态,生理,生化,化学等表型特征和基因组大小,GC含量,基因组组成等基因型特征,确立两者的分类学地位。CHY01T是一株革兰氏阳性,严格需氧,无运动性,内生孢子的菌株。菌株CHY01T在pH 8.0和28℃下生长最适,16S rRNA基因序列分析表明菌株CHY01T属于Brevibacillus属,与其亲缘关系最近的已知菌种是Brevibacillus panacihumi,16S rRNA基因相似度为97.81%。主要的呼吸醌是MK-7,主要的极性脂质是磷脂酰乙醇胺和磷脂酰甘油。主要脂肪酸为 iso-C15:0,C16:0,anteiso-C15:0,C15:1iso H/C13:0 3OH和C16:1ω7c/C16:1ω6c,基因组测序显示基因组大小为5.74 Mbp,G+C 含量为 50.55 mol%。该菌株与 Brevibacillus属的其他已发表菌株的全基因组平均核苷酸同源性(gANI)值和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值均低于区分种的阈值。结合表型特征和基因型特征结果,将CHY01T作为Brevibacillus属的一株新种提出,命名为Brevibacillus dissolubilis,模式菌株为CHY01T(=CGMCC 1.15916T=KCTC 33863T)。GSA152T是一株革兰氏阴性,无鞭毛,好氧,菌落呈桃褐色的菌株。菌株GSA152T在pH7.0和25℃下生长最适,16S rRNA基因序列分析表明菌株GSA152T属于Rhodoferax属,与其亲缘关系最近的已知菌种是Rhodoferax saidenbachensis,16S rRNA基因相似度为98.42%。主要的呼吸醌是Q-8,主要的极性脂质是磷脂酰乙醇胺。主要脂肪酸为C16:0和C16:1ω6c and/or C16:1ω7c。基因组测序显示基因组大小为3.67Mbp,G+C含量为61.17 mol%。该菌株与Rhodoferax属的其他已发表菌株的全基因组平均核苷酸同源性(gANI)值和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值均低于区分种的阈值。结合表型特征和基因型特征结果,将GSA152T作为Rhodoferax属的一株新种提出,命名为Rhodoferax bucti,模式菌株为GSA152T(=CGMCC 1.16288T=KCTC 62564T)。
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