乳腺癌是一种典型的全球性癌症,也是全球女性死亡的最常见原因之一。在组学时代,研究者们采用各种高通量测序技术积累了海量的生物医学数据,在此基础上揭示了越来越多的疾病相关变异/基因。如何有效利用这些数据寻找保护人类健康的新药是一项巨大的挑战。乳腺癌作为一种复杂因素导致的多基因疾病,每种亚型的患者群体,甚至是患者个体都有不同的致病因素。因此,无论是在药物研发阶段还是在临床治疗阶段,都要考虑不同亚型患者对药物治疗反应的差异性,这就需要依靠精准医疗的方法来解决。目前,研究者们普遍认识到精准医疗的重要性,但仍然缺乏真正有效的精准医疗手段。本文基于系统药理学,从乳腺癌患者的基因表达数据出发,使用Gene Rank算法结合基因依赖网络,将患者的基因进行重要性排序,结合药物-靶标数据构建了精准用药系统。该系统根据候选药物是否靶向患者的重要基因判断药物对患者的有效性,从而实现对个体的精准用药。随后,本文利用TCGA数据库中的乳腺癌患者亚型信息以及患者疾病组织和正常组织的基因表达数据,构建了乳腺癌亚型药物预测模型,实现了对乳腺癌亚型群体精准的药物筛选（药物重定位）。通过药物亚型重定位预测,筛选了4对具有潜在治疗三阴性乳腺癌活性的组合药物。根据前药（孪药）设计原理,筛选出结构适合改造、协同指数较高的吉非替尼-伊立替康组合药物。采取多靶点配体（DMLs）设计方法中的缀合法将该组合药物进行结构改造,经化学合成得到新化学实体药物BL-0001。通过人源肿瘤细胞异种移植（CDX）动物模型实验评价,证明了BL-0001及其原组合药物抑制三阴性乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,并促进癌细胞凋亡的活性。在三阴性乳腺癌有效药物极度短缺的背景下,这种将化疗与靶向治疗相结合的多靶点配体药物,有望突破以往三阴性乳腺癌患者只靠化疗药物治疗的局限性,为三阴性乳腺癌的治疗带来了新的希望。