长链非编码RNA相对定量PCR检测方法建立及其在非小细胞肺癌中的初步验证

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[目的]肺癌是全世界癌症相关死亡最常见的原因,非小细胞肺癌占所有肺癌病例的85%,尽管目前在治疗方面已经取得了许多积极进展,但患者的总体生存率仍然较低。大多数患者在诊断时已经发生淋巴结转移,预后不良。急需开发创伤性小且特异度、灵敏度较高,能够早期诊断肺癌的新型生物标志物。越来越多的证据证明了 lncRNA参与非小细胞肺癌发生发展的过程,本次课题基于前期研究基础,在lncRNA芯片结果中挑选一批有潜在价值的lncRNA进行研究,构建相对定量的实时荧光定量PCR检测方法,寻找有潜力作为新型的肿瘤诊断生物标志物的lncRNA分子,为其进一步的功能研究奠定基础,为非小细胞肺癌早期诊断治疗以及预后评估提供新思路。[方法]应用课题组前期LncRNA+mRNA表达谱芯片结果,筛选出8条有潜力作为诊断标志物的候选lncRNA。随后发现其中3条lncRNA分子无法设计适宜引物探针遂进行剔除。紧接着,我们构建多重荧光定量PCR检测方法,验证5条lncRNA分子在20对非小细胞肺癌组织和配对组织以及42例非小细胞肺癌组血清,46例良性肺疾病组血清,48例健康组血清中的表达情况,使用Mann-Whitney非参数检验进行统计学分析。并应用受试者工作特征曲线分析评估其作为诊断非小细胞肺癌的诊断标志物的价值。[结果]本研究基于课题组前期工作,在芯片结果中筛选出5条表达上调、一致性较好 的 lncRNA:XLOC009677,ENSG00000256564.1,ENSG00000249859.2(PVT1),XLOC012568,XLOC001406 作为研究的候选lncRNA。构建多重实时荧光定量PCR相对定量方法,并对各实验条件进行摸索优化。应用所构建的方法验证5条lncRNA在20对肺癌组织和配对组织以及42例非小细胞肺癌组血清,46例良性肺疾病组血清,48例健康组血清中的表达情况。相较于癌旁组织:XLOC009677,ENSG00000249859.2(PVT1),XLOC012568,XLOC001406表达上调,表达结果与芯片结果基本一致,验证了芯片结果的可靠性。随后,筛选出在非小细胞肺癌组和良性肺疾病组以及肺癌组和健康组之间的表达差异具有统计学意义(P<0.05),在良性肺疾病组和健康组之间表达差异无统计学意义(P>0.05)的lncRNA分子:XLOC009677,XLOC012568,XLOC001406。来进行其作为诊断标志物的诊断价值分析。分析结果显示,XLOC009677,XLOC012568,XLOC001406所对应的曲线下面积为:0.647(95%CI:0.532-0.762)、0.642(95%CI:0.527-0.756)、0.707(95%CI:0.601-0.813)。联合检测曲线下面积为:0.747(95%CI:0.527-0.756),3 条 lncRNA均有能够区分非小细胞肺癌患者和健康人群的潜力,且3条lncRNA联合检测用于区分非小细胞肺癌患者和健康人群的诊断价值相对更大。[结论]本研究成功建立5条lncRNA在组织与血清中多重荧光定量PCR检测方法,对实时荧光定量PCR相对定量方法各实验条件进行摸索优化。相较于癌旁组织:XLOC009677,ENSG00000249859.2(PVT1),XLOC012568,XLOC-001406 表达上调;与健康人群血清相比:XLOC009677,XLOC012568,XLOC001406在非小细胞肺癌患者中高表达,具有成为辅助诊断非小细胞肺癌分子标志物的潜力。
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