中国目前还处于社会丰义初级阶段，公立高校在发展中资金短缺现象明显。1985年至今，高等教育体制发生了重大改革，但与此相适应的投入模式却一直没有变化：始终是“综合定额+专项补助”。以学生数作为单一的投入指标，使得规模成为公立高校争取政府投入的首要考虑因素。同时，定额是基于历史经验确定的，并不能全面反映公立高校真实的培养成本。另外，这是一种投入导向的投入模式，未对公立高校的产出形成引导。因此，优化政府对公立高校的投入模式成为本文的研究目标。 第一部分是引言。 第二部分从理论角度分析公立高校政府投入模式优化问题，认为合理的投入模式既能够反映弥补培养成本的需求，又能够激励公立高校提高效率。政府投入模式的优化过程是逐步实现帕累托效率的过程。 第三部分从无绩效指标的公式投入模式和绩效调节的公式投入模式两个方面闸述了发达国家和地区的政府对公立高校的投入模式。 第四部分通过梳理中国公立高校政府投入模式的历史演变，分析了公立高校政府投入模式带来的正、反两方面的效果：一方面，目前的投入模式促进了高等教育大众化，保证了公立高校基本的人员经费需求；另一方面，“综合定额+专项补助”的投入模式定额核算简单、缺少绩效因素、总量导向明显，并且此种投入模式仅应用于教学投入，不涉及科研、基建等资金需求。 第五部分是对中国公立高校政府投入模式优化的制度设计，提出了以分学生层次、学科类别衡量培养成本的投入公式，公式中将普通高等学校质量评估结果作为绩效因了调节公立高校政府投入的效率。 在研究方法上，主要以定性分析为主，同时注意采用定量的分析方法。创新之处主要体现在以下四方面： (1)将弥补成本、效率激励共同纳入公立高校政府投入模式，使得公立高校投入模式满足公平与效率两方面的需求。 (2)应用新古典经济模型建立了政府投入模式优化函数的标准，证明存在投入模式效率函数，投入模式的优化是寻求帕累托效率，以达到帕累托最优的过程。 (3)分析了预算内牛均高等教育经费与生均专用设备之间存在着正相关关系。 (4)设计了提出了以分学生层次、学科类别衡量培养成本的投入公式，公式中将普通高等学校质量评估结果作为绩效因了调节公立高校政府投入的效率，即二元依据论的应用，将公式投入模式和绩效投入模式相结合，形成绩效因素调节的公式投入模式。