我国是水资源丰富的国家,但随着人类的频繁活动,各种化工原料的使用,工业废水、生活污水对水体、水质造成了极大的破坏,因此,当下环保工作的重要内容之一便是水污染的防治工作。若想要做好水污染的防治工作重中之重是从源头抓起,所以在环境法律制度里形成了总量控制、排放权交易、排污许可证等一系列点源控制制度,水污染排污许可证法律制度是一种寄希望于从源头遏制企业排污行为的一种环境保护的法律制度,该种制度是通过控制污水废水的排放总量,以达到保护水质的清洁性的目的。本文共分为五个部分,第一部分是水污染排污许可证法律制度概述,这一章节主要是对水污染排污许可证法律制度的概念进行相关介绍,并通过水污染排污许可证法律制度与大气污染排污许可证法律制度、其他环境保护制度、其他行政许可相对比,分析得出水污染排污许可证法律制度的特征,并对水污染排污法律制度建设的相关理论和水污染排污许可证法律制度的历史发展进行了介绍。第二部分是对我国当前水污染的现状以及水污染排污许可证法律制度的现状进行了梳理,并针对当前水污染排污许可证法律制度的管理体制、监督机制、法律责任等基本制度内容进行了介绍。第三部分是在前一部分分析得出的水污染排污许可证法律制度的现状进行评估,分析得出当前水污染排污许可证法律制度的立法不足、监管不力、缺少人才选拔机制和资金保障机制以及问责机制不完善等方面的问题。第四部分是对国外及我国台湾地区相关法律制度进行了介绍,本文选取了国外的水污染排污许可证法律制度和我国台湾地区的水污染排污许可证法律制度的制度设计部分进行介绍,并从中获得了相应的经验和启示。第五部分是针对第三部分分析出的问题,以及第四部分文中国外及我国台湾地区先进的制度经验,提出了要通过设立行政法规、加强地方立法、完善管理体制与监督机制,明确资金保障和人才选用机制,强化问责机制等法律建议。