在中国经济社会全面转型的背景下，为实现中国经济的提质增效升级，十九大提出将促进全要素生产率的提升作为国家的发展战略，之前学者对于影响全要素生产率的因素也一直在不断进行探索，在前人研究的基础上，本文从研发投入视角出发，将全要素生产率分解为技术水平、纯技术效率以及规模效率，通过分别探究研发投入对这三种效率的影响进一步研究对全要素生产率的影响。随后基于A股上市公司数据，将研发投入与全要素生产率及其分解出来的纯技术效率和规模效率的关系利用面板门槛模型进行实证分析。此外，考虑到企业在生产经营、要素投入等方面的差异，利用系统性聚类分析方法将A股上市企业分为劳动密集型、资本密集型及技术密集型企业，并分别对其进行实证研究。
　　研究结果表明：（1）无论对于何种类型的企业，研发投入与企业全要素生产率总体上呈现一个先促进后抑制的关系，当研发投入水平较低时，研发投入与企业全要素生产率呈现显著的正相关关系，即研发投入的提高会促进全要素生产率的增长，当研发投入到达一定程度时，二者的关系出现了拐点，即研发投入与全要素生产率从正相关变为负相关，此时提高研发投入，全要素生产率反而会降低。（2）在全样本、劳动密集型、资本密集型样本下，研发投入与纯技术效率总体上呈负相关；在技术密集型的样本下，研发投入与纯技术效率并未出现显著负相关关系，而是呈现不显著的正相关关系。（3）在劳动密集型、资本密集型的样本下，研发投入与企业规模效率呈现正相关的关系，加大研发投入资金可以提高规模效率；在全样本和技术密集型样本下，由于高研发投入的观测值较充足，研发投入与规模效率呈倒U型关系。
　　基于实证研究结果，本文从企业和政府角度提出政策建议：对于企业来讲，完善企业创新研发激励措施、完善企业内部研发创新体系；对于政府来讲，加大政府补助力度、完善专利制度以及制定差异化的研发补贴政策和税收优惠政策等。