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目的建立套式逆转录聚合酶链反应(Nested RT-PCR)检测临床样本副流感3型病毒(HPIV3)基因的方法,并进一步对扩增产物进行序列分析,结合临床资料,分析兰州地区HPIV3的感染现状及特征。方法1.收集2005年7月~12月,2006年10月~2007年3月兰州地区的呼吸道感染患儿的300份鼻咽部分泌物(NPS)标本。其中男性162例,女性138例。年龄4天~14岁。2.根据HPIV3血凝素蛋白(HN)的基因保守区设计引物,用套式RT-PCR检测NPS里的HPIV3基因。3.对HPIV3在小儿ARI(acute respiratory tract infection)中所占的比例、性别、年龄、季节分布及临床特点进行分析。4.随机选取11份HPIV3阳性序列,与Genebank上的已知序列进行比对,绘制遗传进化树,从基因进化角度对兰州地区HPIV3的进化特征进行初步探讨。结果1.300例标本用套式RT-PCR检测出HPIV3阳性46例,占总检测标本的15.33%(46/300)。2.在HPIV3阳性46例中,男性26例,感染率为16.04%(26/162),女性20例,,感染率为14.49%(20/138),男性比女性略高。年龄小于3岁的有42例,占总检出率的91.30%(42/46),其中1岁以下的有17例,占总检出率的36.96%(17/46)。急性上呼吸道感染(URI)患儿标本192例,其中HPIV3检测阳性标本32例,(阳性率为16.67%),急性下呼吸道标本108例,其中HPIV3阳性14例(阳性率为12.96%)。3.在所收集标本月份中,每个月份均有HPIV3的检出,其中2005年11月,2007年1月,2月为高峰期。4.随机选取11份阳性标本送检测序,测得的核苷酸序列经过blast软件比较,与GeneBlank中的已知的HPIV3序列同源性在91.0%~99.6%之间。序列结果分析提示,随机选取的RT-PCR阳性的11例标本是HPIV3阳性。 5.基因进化树分析显示,11份阳性样本序列属同一进化枝,6份2006年,10月~2007年,3月的样本序列除145SEQ外属同一进化分枝。而5份2005年的样本序列除1630SEQ外,与日本分离株同属同一进化分枝。结论: 1.HPIV3在兰州地区呼吸道感染患儿中占较高的比例,是引起小儿呼吸道感染的重要呼吸道病原之一,其所致呼吸道感染以3岁以下婴幼儿多见,尤以1岁以下为多,但男女感染比例无显著性差异(x~2=0.3956 p>0.05),上下呼吸道感染率无显著差异(x~2=0.7303 P>0.05)。 2.HPIV3在兰州地区2005年,7月~12月,2006年,10月~2007年,3月中每个月均有散发,但在冬春季形成流行高峰。 3.套式RT-PCR检测方法用于HPIV3的基因诊断具有特异性强,检出率高的优点。 4.通过基因进化树的分析显示,2005年样本序列与2006年样本序列有很近的亲缘关系,但分属两个进化分支,说明这两个时间段的HPIV3流行株在基因进化关系上存在差异,2005年样本序列与日本的HPIV3分离株同属同一进化分支,显示了HPIV3流行株可能存在地域相关性。