巴氏杜氏藻类胡萝卜素合成关键酶基因启动子的克隆及其盐调控分子机制研究

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巴氏杜氏藻(Dunaliellabardawil)属于杜氏藻中的一种,它具有两大特征:(1)能在0mol/L至饱和(5.5mol/L)NaCl浓度范围内生长,是地球上最耐盐植物之一;(2)高盐胁迫下,能够大量累积β-胡萝卜素等类胡萝卜素。β-胡萝卜素的生物合成由八氢番茄红素合成酶(PSY)、八氢番茄红素脱氢酶(PDS)、ζ-胡萝卜素脱氢酶(ZDS)以及番茄红素β-环化酶(LYC-B)等类胡萝卜素合成关键酶(carotenogenicenzymes,CRTs)完成。本论文通过克隆巴氏藻类胡萝卜素合成关键酶基因(carotenogenicgenes,crts)的启动子,分析鉴定盐调控相关元件,研究巴氏藻类胡萝卜素合成的耐盐调控机制。利用基于LA-PCR的基因组步移以及半巢式PCR,克隆并分析Dbpsy、Dbpds、Dbzds、DblycB1的基因结构。Dbpsy、Dbpds、Dbzds、DblycB1启动子分别长3763bp、3010bp、3648bp和2621bp。分析DblycB1基因发现第一个内含子包含一个长57bp的富含GT区,可能与盐胁迫诱导表达有关。分析Dbpds基因发现其5’端与模板不符,利用5’RACE确定其转录起始位点,并进行生物信息学分析,推测该Dbpds乃巴氏藻PDS同工酶基因之一。利用启动子调控元件在线分析工具PlantPAN分析获得的启动子,挖掘潜在盐调控相关元件,发现Dbpsy启动子与DblycB1启动子共享一个潜在盐调控元件(salt-regulatedelement,SRE);Dbzds启动子含有两个潜在低渗调控元件:低渗应答元件(hypoosmolarity-responsiveelement,HRE)和GBF5转录因子结合位点(GBF5binding site,GBF5BS);Dbpds启动子未发现任何盐调控相关元件。检测体内Dbpsy、Dbpds、Dbzds、DblycB1和DblycB2基因响应不同盐浓度的转录水平发现,在高盐浓度下,Dbpsy、DblycB1和DblycB2均受到不同程度的诱导,其中Dbpsy最为明显,极端高盐胁迫(4.5mol/L)极大促进Dbpsy的表达(约为对照的18.479倍);随着盐浓度的下降,Dbpsy、DblycB1和DblycB2的表达明显下降,而Dbzds却受到诱导,其表达量随盐浓度的下降而上调,表明DbPSY、DbLYC-B1和DbLYC-B2是响应高盐胁迫的关键酶,DbZDS是响应低盐胁迫的关键酶。盐胁迫不能显著影响Dbpds的表达量,DbPDS并不是关键酶。极端低盐胁迫(0mol/L)下,尽管其他crts的转录维持在一定水平,Dbpsy维持非常低的表达量(只有对照的约0.069倍),表明DbPSY作为第一个限速酶,在控制碳流向类胡萝卜素合成中具有独特作用; DbLYC-B1和DbLYC-B2同工酶响应不同盐胁迫。极端高盐胁迫可同时促进DbLYC-B1和DbLYC-B2的转录表达;低盐胁迫下,DbLYC-B1维持一定转录水平,而DbLYC-B2的转录水平偏低。推测DbLYC-B1酶基因内含子富含GT区可能与其低盐胁迫表达有关。删除缺失Dbzds启动子HRE元件发现,ble-egfp嵌合基因的低渗诱导表达消失;缺失GBF5BS元件,其表达与野生型Dbzds启动子或Dbzds在体内的表达情况类似,低渗诱导表达不受影响;同时缺失HRE和GBF5BS元件,其表达与缺失HRE元件类似,丧失低渗诱导表达的特性。因此,Dbzds启动子的低渗诱导表达只需要HRE元件,GBF5BS没有低渗调控功能,也不能协同HRE提升Dbzds启动子的低渗表达水平,GBF5BS并不是一个真正的低渗应答元件。同样,缺失DblycB1启动子正义链SRE,DblycB1启动子丧失高盐胁迫表达的功能,SRE赋予DblycB1高盐胁迫表达的功能。CRTs的盐胁迫表达差异与启动子区的调控元件差异相关。
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