16世纪末到18世纪中叶,蒙古社会经历了剧烈的社会动荡和历史演变。在这近200年的时间里,北元的统一、割据与纷争,蒙古与后金,后金与明朝,黄教集团与蒙古、清朝与黄教构成了错综复杂、波澜壮阔的历史画卷。喀尔喀蒙古在这段历史时期同样经历了较大的社会变迁,大体分为16世纪末到17世纪初、17世纪末和18世纪中叶三个时期。第一个时期的特点是整个北元社会的游牧封建政治制度由原来的游牧封建领主制向游牧封建君主制演变,领地成为私产,成为独立封国,领主演变为游牧封建君主。为了给新的封建制度提供可信的理论依据,为使新的封建秩序和大小封建君主的地位具有合法性,为使百姓更好地接受、适应这种社会变化,喀尔喀的大封建主积极引进藏传佛教,并不惜代价地从达赖集团获得“汗”、“楚琥尔”、“格根”等各种等级的封号。藏传佛教为新的封建制度和封建君主权力提供了合理存在的系统的理论依据,赋予了“君权神授”的光环。西藏格鲁派集团为了摆脱藏巴汗政权的迫害,争夺在藏地政教两界的统治地位,积极向蒙古地区宏法,借助蒙古的军事、经济力量达到自己的政治目的。当北元右翼土默特部大封建主阿勒坦汗去世后,右翼陷入分裂,势力衰落时,格鲁派集团开始把战略目光投向漠北地区,与喀尔喀大封建主们携手掀起了“宗教狂热”。第二个时期的特点是喀尔喀遭受准噶尔部大规模的军事进攻,危难之际四部举族迁往漠南,正式归属清王朝。在喀尔喀内附时,宗教领袖哲布尊丹巴活佛发挥了一定的作用。从此,喀尔喀地区成为清王朝的地方行政区划。在清王朝“控驭抚绥”、“因其教不易其俗,齐其政不易其宜”的边疆民族政策下,喀尔喀蒙古社会完全纳入中央集权的封建制度之中,又经历了一