加强对农民的社会保障是社会现代化发展中政府必须承担的责任。新型农村合作医疗制度的推行是我国新农村建设过程中的一项重大举措。目前，我国的新型农村合作医疗处于试点推广阶段，运行机制是否完善合理直接关系到其进一步的发展。本文主要围绕新型农村合作医疗运行机制来考察“新农合”的发展状况。 文章从回顾我国农村合作医疗的发展历程入手，揭示了新型农村合作医疗的产生背景，描述了新型农村合作医疗几年来的试点情况，分析了其取得的成绩及在试点过程中出现的一些问题。在新型农村合作医疗试点推广的过程中，一些地区根据自身实际采取了不同的运行模式。本文选取了“江阴模式”作为个案进行研究，分别从筹资、基金管理、结报补偿和监督方面阐述了江阴新型农村合作医疗的运行机制。江阴新型农村合作医疗经历了几轮的发展形成了自己的特色，基本确立了“征、监、管”相分离的运行机制，尤其是商业保险参与“新农合”基金管理已经获得了广泛认可，但在运行的过程中也出现了一些明显的问题，这些问题的存在影响到了其新型农村合作医疗的可持续发展。通过研究得出，我国的新型农村合作医疗运行机制还需要进一步完善。 最后，本文提出了要尽快建立科学合理的新型农村合作医疗运行机制，在完善制度设计和法律地位的保障基础之上逐步完善运行机制内部各个具体环节。