枣树上类病毒种类鉴定及序列分析

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对采自河北沧州、保定和邯郸的95个枣树样品进行类病毒的检测与序列分析。采集的样品进行了低分子量RNA的提取,然后运用斑点杂交、RT-PCR、二维电泳并转膜杂交和生物学检测等方法进行了检测。结果显示:采自沧州地区齐桥同—“枣树-梨树”间作地块的2个枣树样品检测到了啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd),其他地区样品均未检测到,总检出率为2.1%。本研究发现枣树成为HSVd新的寄主这是世界上首次报道。分别对检测呈阳性的2个枣树样品进行HSVd的克隆、测序分析,首先与首次从啤酒花中分离到的HSVd序列(X00009,1983)进行比较同时与GenBank中已报道的HSVd序列进行对比。结果显示:1.从CZ3和CZ4中各克隆的2个HSVd序列与首次从啤酒花中分离出的HSVd序列(x00009,1983)对比中共发生了25个碱基位点突变,同源性较低。2.从中国枣树上分离得到的HSVd序列总体变异较小,在GenBank序列对比中同源性从92%—100%,且序列变异与地域、寄主等无明显相关性。
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