从经济不发达地区的经济发展实践来看，经济结构的二元性实际上是一个普遍的现象。本文主要是基于区域经济发展的角度,对我国经济发展中亟待解决的关键问题--二元经济结构优化问题进行了深入、系统的探讨与研究，并指出二元经济结构优化目标即实现城乡一体化，这一目标的实现既能从根本上解决“三农”问题，促进社会和谐程度的提高，又能缩小城乡居民收入差距，促进区域可持续发展。论文研究的成果和主要贡献如下：一、简要介绍了本文的研究背景及意义、国内外研究现状、论文的研究内容和采用的主要研究方法和技术路线。二、阐述了二元经济结构研究的重要理论支撑，包括经典马克思主义关于二元经济结构优化的思想、发展经济学关于二元经济结构的基本思想、二元经济结构种现代系统科学的理论价值和区域二元经济结构优化中的科学发展观。三、指出二元经济结构优化的必要性。首先对二元经济结构的涵义进行了界定并阐述了我国二元经济结构的历史演进，进而分析了我国二元经济结构的差异及特征，最后指出二元经济结构引起的经济和社会问题。四、分析了二元经济结构优化的机理。首先对二元经济结构优化的涵义进行界定并在基础上确立了二元经济结构优化的测度指标体系，进而分析了二元经济结构优化的形成机理，最后对二元经济结构优化的制约因素进行了深入分析。五、给出了二元经济结构优化的路径选择，指出二元经济结构优化应选择的路径包括统筹城乡发展、促进一体化建设，加大农业投入、缩小城乡差距，正确处理城与乡、工与农之间的互补关系，加快信息化、城镇化和农业现代化建设等方面。六、分析了二元经济结构优化的动力机制，对国家工业化、城市化和农业现代化在区域二元经济结构优化中的重要作用、作用机理展开了深入分析与探讨。七、分析了二元经济结构优化的统筹机制，对城乡发展规划、城乡产业发展、基础设施和公共服务、劳动就业以及社会管理统筹在区域二元经济结构优化中的重要作用、作用机理和促进对策进行了系统分析。八、分析了二元经济结构优化的保障机制，对政策保障机制、农业支持保护机制、收入分配调整机制、扶贫开发机制、农村社会保障机制在区域二元经济结构优化中的重要作用、作用机理和实施对策展开深入研究。九、以吉林省为例对二元经济结构优化问题进行了实证研究，结合吉林省实际提出了吉林省二元经济结构优化的基本思路和相应的对策措施。