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志贺菌是细菌性痢疾的主要病原体之一，能够分泌直径大小为50-200nm左右的膜囊泡。为了进一步理解志贺菌膜囊泡的生物学功能，对30℃和37℃培养条件下的志贺菌野生型和大质粒缺陷型菌株经密度梯度离心纯化后得到的膜囊泡进行了比较蛋白质组学研究。在四种膜囊泡制备物中，总共鉴定到了591种蛋白。主要包括同源蛋白簇分类中的核糖体结构蛋白(15％)和膜起源蛋白(12％)。其中，野生型菌株的膜囊泡特异性地包被大量三型分泌系统效应因子，而大质粒突变型菌株的膜囊泡特异性地富集了一些代谢相关的蛋白。30℃培养条件下的膜囊泡特异性地富集了氨基酸代谢相关蛋白，而37℃培养条件下的膜囊泡则特异性地包被了Hfp毒力调节蛋白。相关的菌株和膜囊泡组合的细菌入侵实验表明，加入过量37℃培养条件下野生型菌株的膜囊泡时，野生型福氏志贺菌2a301菌株的入侵细菌数会提升3.5倍左右，而过量30℃培养条件下大质粒缺陷型菌株的膜囊泡存在则会显著减弱福氏志贺菌2a301野生型菌株的入侵。综合以上结果，推测膜囊泡特异性地包裹并转运蛋白分子，这些内含物因子直接或间接地参与了志贺菌的入侵调控过程。如37℃培养条件下野生型菌株的膜囊泡中鉴定到的20种T3SS效应因子以及30℃培养条件下大质粒缺陷型菌株的膜囊泡特异富集的H-NS和DamX等蛋白可能是相应的关键蛋白因子。不同条件下的志贺菌膜囊泡比较蛋白质组学结果为提供了膜囊泡可能参与细菌入侵调控的候选蛋白分子库。