【摘 要】
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目的通过生物信息学和免疫组化技术探讨音猬因子(Shh)、平滑受体蛋白(Smo)及神经胶质瘤相关癌基因同源蛋白1(Gli1)在弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)组织中的表达水平及临床意义。方法1.生物信息学分析Shh、Smo及Gli1 mRNA在DLBCL组织中的表达:从TCGA数据库中下载48例DLBCL样本并从GTEx数据库中下载929
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目的通过生物信息学和免疫组化技术探讨音猬因子(Shh)、平滑受体蛋白(Smo)及神经胶质瘤相关癌基因同源蛋白1(Gli1)在弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)组织中的表达水平及临床意义。方法1.生物信息学分析Shh、Smo及Gli1 mRNA在DLBCL组织中的表达:从TCGA数据库中下载48例DLBCL样本并从GTEx数据库中下载929例正常样本mRNA数据,利用生物信息学比较Shh、Smo及Gli1 mRNA在DLBCL和正常样本中的表达情况。利用cbioportal在线数据库找到Shh、Smo及Gli1正相关基因并导入Web Gestalt在线分析平台进行功能注释和通路分析。分析Shh、Smo及Gli1基因的表达与DLBCL患者生存预后的关系。2.免疫组化实验检测Shh、Smo及Gli1蛋白在DLBCL组织中的表达:本研究收集2016年1月至2020年12月在甘肃省人民医院经病理组织活检确诊初发DLBCL患者的临床资料及病理组织标本共58例,另对照组收集淋巴结反应性增生患者组织标本20例。采用免疫组化法检测Shh、Smo及Gli1蛋白在58例DLBCL患者和20例淋巴结反应性增生患者的淋巴组织中的表达情况并分析三者表达与DLBCL患者临床病理特征的关系。结果生物信息学分析结果Shh和Smo mRNA在DLBCL中的表达高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05),DLBCL和正常对照组中Gli1 mRNA表达差异无统计学意义(P>0.05)。功能富集注释和通路分析显示Shh、Smo及Gli1及其正相关基因主要与生物调控、代谢过程、发育过程、嗅觉传导、多细胞组织过程、细胞通讯及基底细胞癌等有关。生物信息学分析表明Shh、Smo及Gli1基因的表达与DLBCL患者的生存期之间无明显相关性(P>0.05)。免疫组化实验结果发现Shh、Smo及Gli1在淋巴结反应性增生组织中的阳性表达率分别为5.0%、5.0%及0.0%,DLBCL组织中的阳性表达率分别为34.4%、41.3%及29.3%,均较对照组中的表达高,三者的差异具有统计学意义(P<0.05)。DLBCL组织中Shh、Smo及Gli1蛋白的表达均与DLBCL患者的Ann-Arbor临床分期明显相关(P<0.05),且分期越晚(Ⅲ+Ⅳ期),Shh、Smo及Gli1蛋白的阳性表达率越高。Shh的表达还与IPI密切相关(P<0.05),Smo的表达还与骨髓侵犯有关,而Gli1的表达还与是否有B症状相关(P<0.05),但Shh、Smo及Gli1的表达均与患者的性别、年龄、β2微球蛋白水平(β2-MG)、乳酸脱氢酶(LDH)、β2微球蛋白水平(β2-MG)及C反应蛋白水平(CRP)水平无关(P>0.05)。结论1.Shh、Smo及Gli1在DLBCL组织中的表达均高于淋巴结反应性增生组织。2.Shh、Smo及Gli1的表达均与DLBCL患者肿瘤临床分期相关,HH信号通路可能在DLBCL中异常激活。3.Shh、Smo及Gli1蛋白在DLBCL组织中高表达,可能参与肿瘤的进展,可能为DLBCL的病因学研究及治疗提供理论依据。
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