在知识经济和信息社会推动下,电子政务日益发展,但伴随着我国政府巨额资金的投入,大量的网络系统、业务系统、数据库等绝大多数并不能实现真正意义上的联通并高效运行,因而对电子政务系统的跟踪评估成了我国电子政务健康快速发展的有效手段。本文在搜集查阅现有文献资料的基础上,首先确定了电子政务绩效评价指标体系建立的原则和思路,并通过对现有常用绩效评估模型进行对比分析,选取和改进了绩效棱柱模型,从利益相关者的满意、贡献、政务流程、能力和网站建设产出等五个维度设计出层次评价指标体系；然后通过对评估方法的对比总结,选择将层次分析法的定量性和客观性与模糊综合评价法的包容性进行有机融合,利用AHP法确定权重,并结合使用模糊隶属赋值法和三角模糊数构建了绩效综合评价的模糊AHP模型；最后,根据所建立的电子政务绩效评价指标体系及模糊AHP模型对某市药监部门电子政务的建设情况进行了综合评价,验证了评价体系及模型的可靠性。本文从绩效棱柱理论出发探讨了电子政务绩效评估,并在改进的绩效棱柱基础上初步构建了电子政务绩效评估指标体系；同时,有机地融合层次分析法与模糊综合评判法建立综合评价模型对电子政务绩效进行了实证评估。为电子政务绩效评估指标体系的构建及应用研究开阔了新的视野,提供了新的方法和手段。