【摘 要】
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目的:近年来,HIV-1新型重组毒株在国内外均呈上升趋势,新型重组毒株的出现影响着HIV-1耐药的发生、疾病进展和免疫逃逸,再次提升了艾滋病防控的难度和疫苗研发的困难。本研究以2020年1月至2021年6月河北省全部新诊断且未经抗病毒治疗的HIV-1感染者为研究对象,采用横断面研究模式,通过分子流行病学分析,来掌握河北省HIV-1新型重组毒株流行情况,阐明河北省HIV-1 URFs近似全长基因特点
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目的:近年来,HIV-1新型重组毒株在国内外均呈上升趋势,新型重组毒株的出现影响着HIV-1耐药的发生、疾病进展和免疫逃逸,再次提升了艾滋病防控的难度和疫苗研发的困难。本研究以2020年1月至2021年6月河北省全部新诊断且未经抗病毒治疗的HIV-1感染者为研究对象,采用横断面研究模式,通过分子流行病学分析,来掌握河北省HIV-1新型重组毒株流行情况,阐明河北省HIV-1 URFs近似全长基因特点,分析河北省HIV-1 URFs感染者中双重感染发生情况,为河北省艾滋病疫情防治提供理论支持。方法:1、以河北省2020年1月-2021年6月新诊断的1176例HIV-1感染者为研究对象,使用逆转录巢式PCR方法扩增血浆样本中的HIV-1gag全长、pol全长、env C2V3基因片段,通过Sangar测序鉴定HIV-1亚型,分析HIV-1新型重组毒株流行情况;2、以鉴定出来的139例HIV-1独特型重组毒株（Unique Recombinant Forms,URFs）感染者为研究对象,使用近似全长基因（Nearly Full-lenghth genome,NFLG）扩增方法扩增血浆样本中的HIV-1近似全长基因,利用Entropy工具进行信息熵比较,分析URFs与细胞毒性T细胞（Cytotoxic T Lymphocyte,CTL）表位相关的特异性位点;3、使用深度测序技术扩增139例HIV-1 URFs感染者血浆样本中的HIV-1 p24基因片段和gp41基因片段,通过相关生信分析手段双重感染发生情况。结果:1、河北省HIV-1新型重组毒株的比例为19.8%（172/867）,其中CRF55＿01B（14/867）、CRF59＿01B（1/867）、CRF65＿cpx（2/867）、CRF68＿01B（4/867）、CRF79＿0107（2/867）、CRF80＿0107（5/867）、CRF103＿01B（4/867）和CRF112＿01B（1/867）的比例分别为1.6%,0.1%,0.2%,0.5%,0.2%,0.6%,0.5%,0.1%.URFs的比例16.0%（139/867）;2、URFs主要重组模式包括:CRF01＿AE/CRF07＿BC（68.3%,95/139）,CRF01＿AE/B（11.5%,16/139）,CRF01＿AE/C（10.0%,14/139）,B/C（5.7%,8/139）,CRF07＿BC/B（0.1%,1/139）,CRF01＿AE/B/C（3.6%,5/139）;3、新型CRFs主要是在2008年以后传入河北省的,并且2009年前后,在性传播人群中形成了本省第一个HIV-1 CRF（CRF103＿01B）,随后逐渐在全省范围内传播流行起来;4、发现并鉴定出一种HIV-1新重组亚型,被HIV database数据库收录并命名为CRF123＿0107;5、使用Entropy工具比较47例URFs与各组参考序列的信息熵,找到了68个位于CTL表位内的特征性位点,这些特征性位点所在的HIV-1基因序列的表达可能改变HIV-1的免疫逃逸;6、利用NGS技术检测出1例CRF07＿BC/B亚型双重感染病例,河北省新诊断HIV-1 URFs感染者中的双重感染率大约为0.7%（1/139）。结论:1、河北省新诊断HIV-1感染者中新型重组毒株比例较高,包括8中新型CRFs和多种URFs;新型重组亚型CRF123＿0107已形成,可能会成为新的流行毒株。2、URFs的基因序列中存在大量与CTL表位相关的特异性位点,影响HIV-1重组病毒株的免疫逃逸反应。3、NGS技术可以检测HIV-1感染者体内的HIV-1准种序列,用于HIV-1双重感染的分析鉴定。
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