知识产权是激励创新和保障创新成果的基础和核心,是一个地区经济增长的重要支柱、是提高一个城市竞争力的动力源泉。进入二十一世纪后,南京等东部沿海经济发达地区率先完成了工业化,开始向知识经济转型,尤其是2008年的国际金融危机爆发后,我国的许多城市更加意识到自主创新对可持续发展的重要性。以南京市为代表的经济发达地区的政府部门更加重视知识产权的作用,纷纷出台知识产权战略和制度,完善知识产权管理机构,争取向发达国家看齐。但我国地方政府的知识产权管理经验毕竟偏少,真正开始研究知识产权管理的时间也就二十年左右,与发达国家政府近百年的知识产权管理时间相比差距甚大,这种差距不仅仅表现在政府知识产权战略、制度和机构设置缺失,还表现为政府经济管理职能的不完善,难以应付日益激烈的国际和地区竞争环境。因此,本文以南京市政府知识产权管理系统为主轴,运用政府职能相关理论、系统理论、SWOT分析方法,在认真分析南京市政府知识产权管理系统的现状和问题的基础上,总结有益经验,提出不足之处和建议措施,希望通过对南京个案的研究,能给其他地方政府在知识产权管理上带来借鉴作用。