在知识经济全球化进程不断加快的背景下,全球范围内就技术、专利、著作权、商标等无形资产形成的交易日趋频繁,进口企业为之支付的跨境特许权使用费数额也迅速增长,在世界贸易中因其高端的研发能力以及批量的优秀人才而占主导地位的跨国集团成为全球收取特许权使用费的大户。这些大户出于各色目的在集团内部关联交易中通过制定或高于或低于公平交易价格的转让定价以转移利润,这不仅会影响国家税收管辖权中的税基分配,而且会剥夺一国政府在公平交易条件下跨境交易本应享有的税收份额。我国对特许权使用费均有税收管辖权的是海关(仅限于与进出口货物相关的那部分特许权使用费)与税务机关。跨国集团日益频繁的转让定价行为,导致我国征收的特许权使用费的税额大量减少,加之我国海关与税务机关之间缺乏有效的联合机制,使得我国对跨国集团转让定价行为的监管仍旧薄弱,最终损害国家整体税收利益。海关与税务机关出于各自利益的需求,可能会出现对同一笔特许权使用费进行越权征税与重复征税的情况。应税企业就该项特许权使用费在被双重征税的同时,还可能被双重估价,这不仅加重了应税企业的成本和负担,而且严重地浪费了政府资源(1)。为防范跨国集团在内部关联交易中利用特许权使用费进行转让定价导致的特许权使用费税款大量流失的情况,为协调我国海关与税务机关在特许权使用费征税管理等方面的冲突,加强海关与税务机关对跨国集团转让定价的联合监管,逐步建立并完善政府间、政府与非政府间的信息交流机制亟待成为当务之急。文章第一部分介绍并分析了特许权使用费的征税路径与估价体系,得知悉特许权使用费有着海关与税务机关的两条税收征管路径,有着海关估价和转让定价调整两个估价体系。文章第二部分分析了特许权使用费的海关估价制度与转让定价调整制度的联系、差异与冲突。重点分析了海关与税务机关就特许权使用费税收制度在税收管辖权、完税价格认定以及申报文件要求方面存在的冲突及其危害。文章第三部分为协调海关与税务机关在特许权使用费征税管理方面的冲突,结合世界海关组织(WCO)与经济合作与发展组织(OECD)的指导意见以及部分国家的协调经验,提出建立特许权使用费征税协调机制的构想,提出建立政府间、政府与非政府间的信息交流机制的建议。这对加强特许权使用费的税收征管工作、缓解应税企业的压力、减少政府资源的浪费以及捍卫国家税收主权与利益具有重要的现实意义。