RNA聚合酶Ⅱ是在真核生物中负责转录和加工mRNA的聚合酶，由12个亚基组成，最大的亚基Rpb1是其主要的功能亚基，决定了转录的起始和延伸。Rpb1存在多种翻译后修饰，如磷酸化、糖基化和泛素化。以往的研究发现，Rpb1的泛素化修饰除参与其正常生理状态下的蛋白质代谢外，还可促进转录过程中停滞在DNA上的Rpb1的降解，以及促进大规模DNA损伤时的转录耦联修复(Transcription Coupled Repair，TCR)。因此，Rpb1的泛素化修饰通过严密调控Rpb1的活性蛋白水平，保证了转录的正常进行，并对DNA损伤修复和保证遗传物质的稳定性、保真性有重要意义。Rpb1的泛素化修饰对调节其活性可能也有重要作用。但目前仅有两个参与DNA损伤时Rpb1泛素化修饰的哺乳类E3泛素—蛋白连接酶(pVHL和BRCA1)被报道，而且生化机制也还不很清楚。　　 Wwp2是实验室在研究胚胎干细胞(ES)转录因子Oct-4的相互作用蛋白时发现并克隆的一个E3泛素—蛋白连接酶，由C2、WW和HECT(Homologous to E6-AP Carboxyl Terminus，HECT)结构域组成。应用Wwp2的WW和HECT结构域的GST融合蛋白与胚胎肿瘤细胞F9裂解液进行亲和层析，发现Wwp2可能与RNA聚合酶Ⅱ的大亚基Rpb1结合。　　 本研究证实了Wwp2与Rpb1存在体外和体内不依赖于Rpb1磷酸化的特异性相互作用，而且这种相互作用是分别通过Wwp2的WW结构域和Rpb1的羧基端CTD(C-terminal domain.)结构域介导的。Wwp2促进了Rpb1的体内、外泛素化修饰，在CTD上存在泛素化修饰的位点，而且，Wwp2依赖的CTD上的多聚泛素化链是通过一种新的生理功能未知的方式连接的。Wwp2介导的Rpb1泛素化修饰和降解不依赖于Rpb1的磷酸化。在正常情况下，Wwp2泛素化修饰并通过泛素一蛋白酶体途径(Ubiquitin Proteasome Pathway，UPP)降解Rpb1，严密调控Rpb1的蛋白质水平。Wwp2还可促进磷酸化的Rpb1的泛素化修饰和降解，这对于及时清理掉转录活跃基因上的发生错误的转录复合体，提高转录的整体效率，保证转录的正常进行有重要意义。Wwp2还参与UV照射引起的Rpb1的泛素化修饰，可能与转录耦联修复有关。研究显示，Wwp2是一个新的Rpb1的E3泛素-蛋白连接酶，而且其生理功能有明显不同于两个已知的的E3泛素一蛋白连接酶之处。因此，关于Wwp2泛素化修饰Rpb1的生化机制的研究，有助于揭示Rpb1的泛素化修饰途径及其在生理和病理条件下的调控机制。