目前，全球土壤盐碱化日益严重。一方面，它给生态系统的平衡带来很大的压力，另一方面严重危害可耕作土壤的面积，成为了影响植物生长发育，制约农业发展的的主要环境问题。如何改良盐渍化土地成为人们普遍关注的问题。盐穗木是(Halostachys caspica)隶属于藜科(Chenopodiaceae)，是盐土荒漠主要植物之一。在饲料贫乏的新疆荒漠草场是良好的饲用牧草；具有独特的生态学、经济和药用价值。主要分布于新疆塔克拉玛干沙漠，吐鲁番盆地等地区。miRNA是一类在真核生物中广泛存在的大小约22nt的非编码的小分子RNA，它通过对靶标mRNA的剪切或抑制靶mRNA的翻译来调控靶标基因的表达。miRNA在生长发育和抗逆胁迫等方面具有十分广泛和非常重要的作用。目前，植物miRNA的研究主要集中在植物基因表达和生长发育等方面，而关于盐生植物miRNA的研究还是较少。而且，植物对抗逆胁迫相应机制中，miRNA研究多数涉及到miRNA基因在多种非生物胁迫下的表达规律和差异，有关miRNA与其靶基因的相互作用的研究仍然比较缺乏。本课题以盐穗木为研究材料，利用高通量测序技术构建了盐胁迫下盐穗木根的miRNA文库。本文对其进行了初步的评价；通过分析对照组和处理组miRNA的表达，初步筛选了部分miRNA（miR398和miR395）进行后续的研究。通过同源克隆法克隆获得了miR398和miR395的靶基因CSD1、CSD2和APS1的全长序列，通过生物信息学软件分析并初步证明了miRNA与靶基因之间可能的互补关系，最后利用实时定量PCR技术分析了miR398和miR395在高盐胁迫下的表达规律。本实验为后续研究miRNA在盐穗木中耐盐机制提供了一定的信息和理论支持。