来源于多形拟杆菌的乙酰酯酶BT4096晶体结构解析

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:arx2007
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地尔硫卓是一种非二氢吡啶类钙离子拮抗剂,作为临床药物具有高选择性、高耐受性、广适用性等特点,目前已广泛用于治疗高血压、心绞痛以及心律失常等心血管疾病。地尔硫卓在体内代谢可生成多种代谢产物,这些代谢产物多具有药物活性,对钙离子通道有着不同的抑制作用。地尔硫卓及其代谢物在体内的脱乙酰作用依赖于一种来源于肠道微生物多形拟杆菌的乙酰酯酶BT4096(GenBank,NP813007.1)。本实验以BT4096蛋白为研究对象,对其进行表达、纯化及晶体结构解析。BT4096截去其N端信号肽后有440个氨基酸,分子量为51 kDa,全基因合成并构建在pET32a载体上,后转入工程菌株BL21(DE3)中进行表达。通过两次镍亲和层析纯化,获得了符合结晶纯度的BT4096蛋白溶液。晶体条件的初筛通过微量蒸汽扩散-坐滴法,使用商业化结晶试剂盒对晶体条件进行筛选。晶体衍射数据的收集在同步辐射中心进行。利用单波长反常散射的方法解析了BT4096的相位,通过PHENIX搭建初始结构模型,使用COOT进行结构修正,最终获得分辨率为2.33 A的结构。BT4096的结构可分为两个部分,N端结构域具有SGNH家族水解酶特征,其催化三联体为:S18、D194和H197。其中S18的羟基氧做为亲核试剂攻击底物上的羰基碳,反应由此发生。C端结构域由β-桶和α-螺旋区组成,经比对β-桶结构与Ig-like结构类似,在功能上增强与底物的结合能力。本课题成功解析出来自肠道微生物多形拟杆菌乙酰酯酶BT4096的结构,并提出了一种与地尔硫卓的底物结合模型,这将对SGNH家族内其他未知成员的结构解析和研究奠定基础,对肠道微生物代谢药物地尔硫卓提供理论模型,具有重要的生物学意义。
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